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学者姓名：熊翠玲
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本发明涉及教学用具技术领域，具体涉及一种教学系统，包括教学器具，教学器具包括轧光机、轧花机、风机和静电起电机；轧光机和轧花机均包括机架、驱动电机、控制器；机架具有喂入侧，机架包括上挡板和下挡板；上挡板设有第一出风口，下挡板设有第二出风口；第一出风口、第二出风口分别与风机连通；第一出风口、第二出风口上设有多条与静电起电机连接的柔性导电丝；判断柔性导电丝的电荷量是否发生波动，若是则认定为与人体接触则急停；本发明通过利用蜂蜡绝缘、人体导电的特点，结合柔性导电丝配合静电起电机，上下挡板的柔性导电丝带不同电荷与人体发生接触造成电位变化控制驱动电机的急停，进而实现安全的教学演示、规范实操人员的动作。
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| GB/T 7714 | 熊翠玲 , 朱翔杰 , 徐新建 et al. 一种教学系统 : CN202510033682.4[P]. | 2025-01-09 . |
| MLA | 熊翠玲 et al. "一种教学系统" : CN202510033682.4. | 2025-01-09 . |
| APA | 熊翠玲 , 朱翔杰 , 徐新建 , 周姝婧 , 陈大福 . 一种教学系统 : CN202510033682.4. | 2025-01-09 . |
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Abstract ：
本发明涉及蜜蜂科学技术领域，具体涉及一种利用蜂蜡制作巢脾的3D打印方法，包括采用加热装置对蜂蜡进行预热，步骤二、将巢脾需要打印的形状提前导入到3D打印机内，巢脾的四侧边沿上分别设置有多个连接边沿和多个缺口；将巢脾的形状切割成多层的打印路径，与连接边沿打印路径为连接段，设定最底层的打印路径的其中一个连接段为起始段；将未打印的巢础框水平放置在打印机上，当打印起始段或连接段时液态蜂蜡挤出量为其他打印路径的1.2‑1.5倍，同时关闭冷却风扇或降低冷却风扇转速；本发明通过加热装置对蜂蜡进行预热，将蜂蜡作为打印的基材，使得蜜蜂在筑巢时无需筑造巢脾，直接可以使用已经打印好的巢脾，无需消耗蜂蜡和时间。
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| GB/T 7714 | 熊翠玲 , 邱剑丰 , 陈大福 et al. 一种利用蜂蜡制作巢脾的3D打印方法 : CN202411765761.6[P]. | 2024-12-04 . |
| MLA | 熊翠玲 et al. "一种利用蜂蜡制作巢脾的3D打印方法" : CN202411765761.6. | 2024-12-04 . |
| APA | 熊翠玲 , 邱剑丰 , 陈大福 , 赵浩东 , 张天泽 , 吴函雨 et al. 一种利用蜂蜡制作巢脾的3D打印方法 : CN202411765761.6. | 2024-12-04 . |
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Abstract ：
[目的]解析意大利蜜蜂Apis mellifera ligustica工蜂幼虫肠道发育过程中的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)差异表达谱,并揭示差异表达lnc RNA (differentially expressed lncRNA,DElncRNA)在幼虫肠道发育中的调控作用。[方法]基于前期获得的意大利蜜蜂工蜂4,5和6日龄幼虫肠道转录组数据(分别为Am4,Am5和Am6),利用相关软件筛选Am4vs Am5比较组和Am5 vs Am6比较组中的DElncRNA,分析DElncRNA和两个比较组中共同上调和下调lncRNA的顺式调控作用和竞争性内源RNA (competing endogenous RNA,ceRNA)的调控作用。通过RTqPCR验证转录组数据的可靠性。[结果]在Am4 vs Am5比较组中筛选出214条上调和251条下调lncRNA,在Am5 vs Am6比较组中筛选出141条上调和332条下调lncRNA;两个比较组共有的上调和下调lncRNA分别为7和16条。Am4 vs Am5比较组中的DElncRNA潜在调控250个邻近基因,涉及细胞进程等28个GO条目及Wnt信号通路等58条KEGG通路;Am5vs Am6比较组中的DElncRNA潜在调控295个邻近基因,涉及细胞部分等35个GO条目及FoxO信号通路等73条KEGG通路;上述两个比较组中共有的7个上调lncRNA潜在调控10个邻近基因,涉及1个GO条目及代谢通路、谷胱甘肽代谢和核质转运等7条KEGG通路。共有的16个下调lncRNA潜在调控27个邻近基因,涉及8个GO条目及精氨酸生物合成、谷胱甘肽代谢和代谢通路等13条KEGG通路。此外,Am4 vs Am5比较组中的49条lncRNA可靶向16个DEmiRNA进而靶向122条DEmRNA,可注释到代谢进程等24个GO条目和Wnt信号通路等21条KEGG通路。Am5 vs Am6比较组中的38条DElncRNA可靶向8条DEmiRNA进而靶向67条DEmRNA,可注释到催化活性等21个GO条目和FoxO信号通路等10条KEGG通路;上述两个比较组共有的1条下调lncRNA MSTRG.10589.2可靶向ame-miR-6052和miR-511-y,进而靶向29条DEmRNA。RT-qPCR结果显示随机选取的7条DElncRNA的相对表达量...
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发育 发育 工蜂 工蜂 幼虫 幼虫 意大利蜜蜂 意大利蜜蜂 肠道 肠道 长链非编码RNA 长链非编码RNA
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| GB/T 7714 | 赵浩东 , 臧贺 , 叶道有 et al. 意大利蜜蜂工蜂幼虫肠道发育过程中lncRNA的表达谱和调控作用 [J]. | 昆虫学报 , 2024 , (08) : 1-13 . |
| MLA | 赵浩东 et al. "意大利蜜蜂工蜂幼虫肠道发育过程中lncRNA的表达谱和调控作用" . | 昆虫学报 08 (2024) : 1-13 . |
| APA | 赵浩东 , 臧贺 , 叶道有 , 陈颖 , 王宁 , 吴鹰 et al. 意大利蜜蜂工蜂幼虫肠道发育过程中lncRNA的表达谱和调控作用 . | 昆虫学报 , 2024 , (08) , 1-13 . |
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Abstract ：
本发明涉及蜜蜂养殖技术领域，具体涉及一种监测和改善蜜蜂生长环境的养殖系统，包括控制器、温湿度控制装置、摄像头和蜂箱；蜂箱包括箱体、巢框、温湿度传感器、操作板；巢框垂直且并排设置在箱体内，巢框之间、巢框与箱体内壁之间具有间隔，间隔内设置有温度传感器和湿度传感器，与间隔对应的箱体上设置有多个上下设置的通孔；操作板上有插入棒，插入棒内部有通道，通道的末端为出气口，温湿度控制装置分别与通道连通；插入棒与通孔位置相对；本发明通过摄像头插入通孔内，对蜂箱内的不同巢框上巢脾进行分类，然后统计不同脾所需的温度和湿度，再根据实际的温度和湿度与所需的温度和湿度配合温湿度控制装置输出气体实现温度和湿度的精细化控制。
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| GB/T 7714 | 熊翠玲 , 邱剑丰 , 陈大福 et al. 一种监测和改善蜜蜂生长环境的养殖系统 : CN202411404185.2[P]. | 2024-10-09 . |
| MLA | 熊翠玲 et al. "一种监测和改善蜜蜂生长环境的养殖系统" : CN202411404185.2. | 2024-10-09 . |
| APA | 熊翠玲 , 邱剑丰 , 陈大福 , 杜丽婷 , 陈颖 , 焦明星 . 一种监测和改善蜜蜂生长环境的养殖系统 : CN202411404185.2. | 2024-10-09 . |
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Abstract ：
本发明涉及蜜蜂养殖技术领域，具体涉及一种患病蜜蜂的筛选抓取方法，包括建立经过学习能够对具有病害蜜蜂进行识别的识别模型；通过识别模型对蜂箱内的蜜蜂进行识别、标记并将识别的病害上传终端；对筛选标记的蜜蜂进行抓取；抓取完成后向终端发送被抓取的患病蜜蜂信息；本发明的通过对现有的蜂箱进行改造，由能够进行标记、识别、抓取病害蜜蜂，防止传染性病害进行进一步的扩散；识别模型能够套用多个蜂箱，实现各种患病蜜蜂的抓取，通过将患病蜜蜂收集，养殖人员能够通过终端获取患病蜜蜂信息进行布置对策，或者专业人员能够通过终端对收集的患病蜜蜂进行研究判断。
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| GB/T 7714 | 熊翠玲 , 邱剑丰 , 陈大福 et al. 一种患病蜜蜂的筛选抓取方法 : CN202411440890.8[P]. | 2024-10-16 . |
| MLA | 熊翠玲 et al. "一种患病蜜蜂的筛选抓取方法" : CN202411440890.8. | 2024-10-16 . |
| APA | 熊翠玲 , 邱剑丰 , 陈大福 , 杜丽婷 , 陈颖 , 焦明星 . 一种患病蜜蜂的筛选抓取方法 : CN202411440890.8. | 2024-10-16 . |
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Abstract ：
Simple Summary At present, interaction between Nosema ceranae and Apis cerana is poorly understood, though A. cerana is the original host for N. ceranae. Here, comparative investigation was conducted using transcriptome data from N. ceranae infecting Apis cerana cerana workers at seven days post inoculation (dpi) and 10 dpi (NcT1 and NcT2 groups) as well as N. ceranae spores (NcCK group). There were 1411, 604, and 38 DEGs identified in NcCK vs. NcT1, NcCK vs. NcT2, and NcT1 vs. NcT2 comparison groups. Additionally, 10 upregulated genes and nine downregulated ones were shared by above-mentioned comparison groups. GO classification and KEGG pathway analysis suggested that these DEGs were engaged in a number of key functional terms and pathways such as cell part and glycolysis. Further analysis indicated that most of virulence factor-encoding genes were upregulated, while a few were downregulated during the fungal infection. Findings in this current work provide a basis for clarifying the molecular mechanism udnerlying N. ceranae infection and host-microsporidian interaction during bee nosemosis. Apis cerana is the original host for Nosema ceranae, a widespread fungal parasite resulting in honey bee nosemosis, which leads to severe losses to the apiculture industry throughout the world. However, knowledge of N. ceranae infecting eastern honey bees is extremely limited. Currently, the mechanism underlying N. ceranae infection is still largely unknown. Based on our previously gained high-quality transcriptome datasets derived from N. ceranae spores (NcCK group), N. ceranae infecting Apis cerana cerana workers at seven days post inoculation (dpi) and 10 dpi (NcT1 and NcT2 groups), comparative transcriptomic investigation was conducted in this work, with a focus on virulence factor-associated differentially expressed genes (DEGs). Microscopic observation showed that the midguts of A. c. cerana workers were effectively infected after inoculation with clean spores of N. ceranae. In total, 1411, 604, and 38 DEGs were identified from NcCK vs. NcT1, NcCK vs. NcT2, and NcT1 vs. NcT2 comparison groups. Venn analysis showed that 10 upregulated genes and nine downregulated ones were shared by the aforementioned comparison groups. The GO category indicated that these DEGs were involved in a series of functional terms relevant to biological process, cellular component, and molecular function such as metabolic process, cell part, and catalytic activity. Additionally, KEGG pathway analysis suggested that the DEGs were engaged in an array of pathways of great importance such as metabolic pathway, glycolysis, and the biosynthesis of secondary metabolites. Furthermore, expression clustering analysis demonstrated that the majority of genes encoding virulence factors such as ricin B lectins and polar tube proteins displayed apparent upregulation, whereas a few virulence factor-associated genes such as hexokinase gene and 6-phosphofructokinase gene presented downregulation during the fungal infection. Finally, the expression trend of 14 DEGs was confirmed by RT-qPCR, validating the reliability of our transcriptome datasets. These results together demonstrated that an overall alteration of the transcriptome of N. ceranae occurred during the infection of A. c. cerana workers, and most of the virulence factor-related genes were induced to activation to promote the fungal invasion. Our findings not only lay a foundation for clarifying the molecular mechanism underlying N. ceranae infection of eastern honey bee workers and microsporidian-host interaction.
Keyword ：
Apis cerana cerana Apis cerana cerana differentially expressed gene differentially expressed gene honey bee honey bee infection mechanism infection mechanism microsporidian microsporidian Nosema ceranae Nosema ceranae transcriptome transcriptome
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| GB/T 7714 | Fan, Yuanchan , Wang, Jie , Yu, Kejun et al. Comparative Transcriptome Investigation of Nosema ceranae Infecting Eastern Honey Bee Workers [J]. | INSECTS , 2022 , 13 (3) . |
| MLA | Fan, Yuanchan et al. "Comparative Transcriptome Investigation of Nosema ceranae Infecting Eastern Honey Bee Workers" . | INSECTS 13 . 3 (2022) . |
| APA | Fan, Yuanchan , Wang, Jie , Yu, Kejun , Zhang, Wende , Cai, Zongbing , Sun, Minghui et al. Comparative Transcriptome Investigation of Nosema ceranae Infecting Eastern Honey Bee Workers . | INSECTS , 2022 , 13 (3) . |
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Abstract ：
为探究东方蜜蜂微孢子虫(Nosema ceranae)胁迫下意大利蜜蜂(Apis mellifera ligustica,简称意蜂)工蜂的piRNA差异表达表达谱及潜在功能，本研究利用前期获得的东方蜜蜂微孢子虫接种7 d和10 d的意蜂工蜂中肠(AmT1组和AmT2组)及未接种工蜂中肠(AmCK1组和AmCK2组)转录组数据筛选出宿主响应胁迫的差异表达piRNA(Differentially expressed piRNA, DEpiRNA),并通过相关软件预测和分析DEpiRNA的靶mRNA,进而利用Stem-loop RT-PCR和qPCR对随机选取的DEpiRNA进行验证.结果显示在AmCK1 vs AmT1和AmCK2 vs AmT2比较组分别筛选出50和207个DEpiRNA;上述两个比较组共有的DEpiRNA为10个，特有的DEpiRNA分别为40和197个；共有的DEpiRNA piR-ame-1128833可靶向3021条mRNA;Stem-loop RT-PCR验证结果显示4个DEpiRNA均真实表达；qPCR结果显示4个DEpiRNA的表达趋势与测序数据中的表达趋势一致.研究结果揭示了东方蜜蜂微孢子虫胁迫引起意蜂工蜂中肠piRNA表达谱的改变；DEpiRNA可通过靶向相关mRNA潜在调控宿主对东方蜜蜂微孢子虫胁迫的响应.
Keyword ：
piRNA piRNA 东方蜜蜂微孢子虫 东方蜜蜂微孢子虫 意大利蜜蜂 意大利蜜蜂 胁迫响应 胁迫响应 调控网络 调控网络
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| GB/T 7714 | 许雅静 , 孙明会 , 刘佳美 et al. 东方蜜蜂微孢子虫胁迫下意大利蜜蜂工蜂的piRNA差异表达谱及潜在功能 [J]. | 四川大学学报(自然科学版) , 2022 , 59 (03) : 178-186 . |
| MLA | 许雅静 et al. "东方蜜蜂微孢子虫胁迫下意大利蜜蜂工蜂的piRNA差异表达谱及潜在功能" . | 四川大学学报(自然科学版) 59 . 03 (2022) : 178-186 . |
| APA | 许雅静 , 孙明会 , 刘佳美 , 郭意龙 , 胡颖 , 张佳欣 et al. 东方蜜蜂微孢子虫胁迫下意大利蜜蜂工蜂的piRNA差异表达谱及潜在功能 . | 四川大学学报(自然科学版) , 2022 , 59 (03) , 178-186 . |
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Abstract ：
[目的]本研究旨在通过差异表达基因(differentially expressedgene,DEG)分析以及毒力因子和其他侵染相关因子分析,在转录组水平揭示东方蜜蜂微孢子虫Nosema ceranae侵染意大利蜜蜂Apis melliferaligustica的分子机制。[方法]基于前期已获得高质量的东方蜜蜂微孢子虫纯化孢子(NcCK)及侵染意大利蜜蜂工蜂7和10 d的东方蜜蜂微孢子虫(分别为NcT1和NcT2)转录组数据,根据P≤0.05且|log2 (Fold change)|≥1的标准,通过比较分析筛选出NcCK vs NcT1,NcCK vs NcT2和NcT1 vs NcT2比较组的DEG。通过相关生物信息学软件对上述DEG进行Venn分析、GO分类和KEGG代谢通路富集分析。根据Nr和KEGG数据库注释信息和相关文献进行对东方蜜蜂微孢子虫的毒力因子和侵染相关因子的统计和分析。通过RT-qPCR验证转录组数据及DEG表达趋势。[结果]从NcCK vs NcT1,NcCK vs NcT2和NcT1 vs NcT2比较组分别鉴定出1397,1497和52个DEG。Venn分析结果显示各比较组共有的上调和下调基因分别为10和1个。G0分类结果显示,NcCKvsNcT1和NcCKvsNcT2中DEG富集数最多的功能条目为代谢进程、细胞进程、单组织进程、细胞、细胞组件、细胞器、催化活性和结合,而NcT1 vs NcT2中DEG富集数最多的是代谢进程、细胞进程、单组织进程、催化活性和结合。KEGG代谢通路富集分析结果显示,NcCK vs NcT1和NcCK vs NcT2中DEG分别富集到80和79条通路;富集在糖酵解/糖异生和MAPK信号通路的上调基因数量多于下调基因。毒力因子分析结果显示,孢壁蛋白9基因和孢壁蛋白12基因在NcCK vs NcT1和NcCK vs NcT2中均下调表达,孢壁蛋白8基因仅在NcCK vs NcT1中表达量下调;此外孢壁蛋白前体基因、孢壁和锚定盘复合蛋白基因、几丁质合酶基因、极管蛋白基因、蓖麻毒素B凝集素基因的表达水平在NcCK vs NcT1和NcCK vs NcT2中表现为上调。侵染相关因子分析结果表明,糖酵解途径的3个关键酶基因在NcCK vs NcT1和NcCK vs NcT2中上调表达;3个涉及ATP/ADP移位酶的基因在NcCK vs NcT1和NcCK vs NcT2中上调表达,但有1个表达量下调;2个涉及ABC转运蛋白的基因在NcCK vs NcT1和NcCK vs NcT2中上调表达,另有4个下调表达。RT-qPCR结果证实了本研究中转录组数据及DEG表达趋势的真实可靠性。[结论]本研究通过比较分析解析东方蜜蜂微孢子虫侵染意大利蜜蜂工蜂过程的转录组动态,揭示了孢壁蛋白、孢壁和锚定盘复合蛋白、几丁质酶、极管蛋白和蓖麻毒素B凝集素等毒力因子编码基因,以及己糖激酶、丙酮酸激酶、6-磷酸果糖激酶、ATP/ADP移位酶和ABC转运蛋白等侵染相关因子编码基因在病原增殖中扮演重要角色,为阐明东方蜜蜂微孢子虫的侵染机制提供了基础。
Keyword ：
东方蜜蜂微孢子虫 东方蜜蜂微孢子虫 侵染机制 侵染机制 侵染相关因子 侵染相关因子 差异表达基因 差异表达基因 意大利蜜蜂 意大利蜜蜂 毒力因子 毒力因子 转录组 转录组
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| GB/T 7714 | 耿四海 , 周丁丁 , 熊翠玲 et al. 转录组分析揭示东方蜜蜂微孢子虫侵染意大利蜜蜂的分子机制 [C] //2021年中国（广西梧州）蜂业博览会暨全国蜂产品市场信息交流会论文集（下册） . 2021 . |
| MLA | 耿四海 et al. "转录组分析揭示东方蜜蜂微孢子虫侵染意大利蜜蜂的分子机制" 2021年中国（广西梧州）蜂业博览会暨全国蜂产品市场信息交流会论文集（下册） . (2021) . |
| APA | 耿四海 , 周丁丁 , 熊翠玲 , 郑燕珍 , 付中民 , 徐国钧 et al. 转录组分析揭示东方蜜蜂微孢子虫侵染意大利蜜蜂的分子机制 2021年中国（广西梧州）蜂业博览会暨全国蜂产品市场信息交流会论文集（下册） . (2021) . |
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Abstract ：
目的：蜜蜂球囊菌(Ascosphaera apis,简称球囊菌)是专性侵染蜜蜂幼虫的致死性真菌病原.MicroRNA(miRNA)作为一类重要的基因表达调控因子,能够广泛参与真菌及其宿主的相互作用过程.本研究通过比较分析球囊菌孢子(AaCK)和侵染中华蜜蜂(Apis cerana cerana,简称中蜂)6日龄幼虫肠道内的球囊菌(AaT)的small RNA(sRNA)组学数据对球囊菌的差异表达miRNA(differentially expressed miRNA,DEmiRNA)、靶mRNA及二者间的调控网络进行全面解析,旨在揭示miRNA介导的球囊菌对中蜂幼虫的侵染机制. 方法：对于球囊菌侵染的中蜂6日龄幼虫肠道的small RNA-seq(sRNA-seq)数据,利用BLAST工具连续比对东方蜜蜂(Apiscerana)和球囊菌的参考基因组筛滤得到AaT的sRNA组学数据.分别将AaCK和AaT的sRNA组学数据比对miRBase数据库,对球囊菌侵染宿主前后miRNA的数量和结构特征进行分析.联用RNAhybrid+svm_light、Miranda和TargetScan软件预测AaCKvsAaT比较组中DEmiRNA的靶mRNA,进而利用相关生物信息学软件对上述靶mRNA进行GO分类和KEGG代谢通路富集分析.通过Cytoscape软件对DEmiRNA-mRNA调控网络进行可视化.利用Stem-loop RT-PCR、RT-qPCR和分子克隆验证测序结果的可靠性. 结果：在AaCK和AaT中分别鉴定到380和387个miRNA.结构特征分析结果显示,AaCK和AaT的miRNA皆集中分布在18-25nt,且首位碱基主要偏向于U.AaCK vs AaT比较组共有270个DEmiRNA,包含155个上调miRNA和115个下调miRNA,分别靶向结合6091和6145个mRNA.GO分类结果显示,上述靶mRNA主要涉及代谢进程、细胞进程、应激反应等15个生物学进程;细胞、细胞组分、细胞器等12个细胞组分;催化活性、结合、转运子活性等11个分子功能.KEGG代谢通路富集分析结果显示,上述靶mRNA富集在123条代谢通路,参与对氨基酸代谢、碳水化合物代谢以及核苷酸代谢等物质代谢,氧化磷酸化、硫代谢、氮代谢等能量代谢,以及MAPK和Hippo等信号通路的调控.球囊菌DEmiRNA与靶mRNA之间存在复杂的调控关系,其中miR-29-x、miR-250-x、miR-4968-y、miR-11200-x、novel-m0023-5p、novel-m0130-5p和novel-m0135-5p等DEmiRNA可靶向结合与球囊菌的半胱氨酸蛋白酶、DNA甲基化转移酶以及几丁质酶相关的mRNA;此外,miR-7-x、miR-9-z、miR-319-y和miR-5951-y等同时参与调控MAPK信号通路;进一步分析发现,miR-250-x同时参与对DNA甲基化转移酶、MAPK信号通路及其他酶类合成与代谢途径的调控,并可能参与球囊菌与中蜂6日龄幼虫之间的跨界调控.通过Stem-loop RT-PCR和RT-qPCR验证了4个DEmiRNA的差异表达,并利用分子克隆和Sanger测序证实miR-7-x的序列与测序结果一致. 结论：本研究解析了侵染中蜂6日龄幼虫的球囊菌的miRNA差异表达谱及DEmiRNA的调控网络,揭示了球囊菌DEmiRNA可能通过调控病原的物质和能量代谢、增殖、毒力、信号通路及相关mRNA参与对中蜂幼虫的侵染过程.miR-7-x、miR-250-x、novel-m0023-5p等关键DEmiRNA有望作为白垩病治疗的新型分子靶点.
Keyword ：
中华蜜蜂 中华蜜蜂 侵染机制 侵染机制 幼虫 幼虫 微小RNA 微小RNA 蜜蜂球囊菌 蜜蜂球囊菌
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| GB/T 7714 | 熊翠玲 , 杜宇 , 郑燕珍 et al. 侵染中华蜜蜂6日龄幼虫的蜜蜂球囊菌的微小RNA差异表达谱及调控网络 [C] //2021年中国(广西·梧州)蜂业博览会暨全国蜂产品市场信息交流会论文集 . 2021 : 368-384 . |
| MLA | 熊翠玲 et al. "侵染中华蜜蜂6日龄幼虫的蜜蜂球囊菌的微小RNA差异表达谱及调控网络" 2021年中国(广西·梧州)蜂业博览会暨全国蜂产品市场信息交流会论文集 . (2021) : 368-384 . |
| APA | 熊翠玲 , 杜宇 , 郑燕珍 , 付中民 , 徐国钧 , 陈大福 et al. 侵染中华蜜蜂6日龄幼虫的蜜蜂球囊菌的微小RNA差异表达谱及调控网络 2021年中国(广西·梧州)蜂业博览会暨全国蜂产品市场信息交流会论文集 . (2021) : 368-384 . |
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Abstract ：
【目的】本研究旨在明确蜜蜂球囊菌(Ascosphaera apis,简称球囊菌)菌丝和孢子中环状RNA(circular RNA,circRNA)的数量、种类和表达谱差异,并探讨共有circRNA、特有circRNA和差异表达circRNA(differentiallyexpressedcircRNA,DEcircRNA)在菌丝与孢子中的潜在作用。【方法】基于前期获得的球囊菌菌丝(AaM)和孢子(AaS)的高质量RNA-seq数据,利用find_circ软件预测circRNA。通过Venn分析筛选AaM和AaS的共有circRNA和特有circRNA。根据P≤0.05且|log2 fold change|≥1的标准筛选AaM vs. AaS比较组的DEcircRNA。通过比对GO和KEGG数据库对circRNA的来源基因进行功能和通路注释。利用TargetFinder软件预测circRNA靶向结合的miRNA及miRNA靶向结合的mRNA。采用Cytoscape软件对竞争性内源RNA (competing endogenous RNA,ceRNA)调控网络进行可视化。通过RT-qPCR对DEcircRNA进行验证。【结果】AaM和AaS中分别含有13210156和19011000条短序列读段(anchors reads),其中分别有6124922和11392886条能够比对上球囊菌参考基因组。在AaM和AaS中分别鉴定到1868个和2225个circRNA,二者共有的circRNA为1098个,AaM的特有circRNA为770个,AaS的特有circRNA为1127个。AaM和AaS的circRNA长度主要介于1000–2000 nt,基因间区circRNA为主要环化类型。AaMvs.AaS比较组包含456个上调circRNA和97个下调circRNA。共有circRNA的来源基因可注释到29个功能条目和14类通路;AaM的特有circRNA的来源基因可注释到31个功能和17类通路;AaS的特有circRNA的来源基因可注释到34个功能条目和16类通路;DEcircRNA的来源基因可注释到29个功能条目和40条通路。调控网络分析结果显示,36个共有circRNA靶向4个miRNA进而调控6个与内吞作用通路相关的靶m RNA;4(255)个AaM(AaS)的特有circRNA靶向2(2)个miRNA进而调控8(2)个次级代谢产物生物合成通路相关的靶m RNA;9个DEcircRNA靶向2个DEmiRNA进而调控3个MAPK信号通路相关的DEm RNA。RT-qPCR结果显示10个DEcircRNA的表达趋势与测序数据一致,证实了测序数据的可靠性。【结论】球囊菌菌丝和孢子的共有circRNA、特有circRNA和DEcircRNA可能通过调控来源基因表达和充当ce RNA的方式调节球囊菌的物质和能量代谢、内吞作用、次级代谢产物生物合成和MAPK信号通路,进而影响球囊菌菌丝生长、孢子萌发和致病性。
Keyword ：
孢子 孢子 微小RNA 微小RNA 环状RNA 环状RNA 白垩病 白垩病 竞争性内源RNA 竞争性内源RNA 菌丝 菌丝 蜜蜂球囊菌 蜜蜂球囊菌
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| GB/T 7714 | 陈华枝 , 蒋海宾 , 祝智威 et al. 蜜蜂球囊菌菌丝和孢子中环状RNA的鉴定及比较分析 [J]. | 微生物学报 , 2021 , 61 (05) : 1299-1314 . |
| MLA | 陈华枝 et al. "蜜蜂球囊菌菌丝和孢子中环状RNA的鉴定及比较分析" . | 微生物学报 61 . 05 (2021) : 1299-1314 . |
| APA | 陈华枝 , 蒋海宾 , 祝智威 , 范元婵 , 许雅静 , 孙明会 et al. 蜜蜂球囊菌菌丝和孢子中环状RNA的鉴定及比较分析 . | 微生物学报 , 2021 , 61 (05) , 1299-1314 . |
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