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学者姓名：林培清
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为开发黄麻SSR引物,为黄麻分子标记辅助育种等研究提供有利工具,在黄麻转录组测序的基础上,采用MicroSAtellite(MISA)软件进行SSRs搜索,并对部分SSR引物的多态性进行验证,结果表明:1)在1kb以上的13 718条unigene中,共检测到8 571个SSR位点,占评估序列数目的62.47%,平均每3.47kb有1个SSR;2)所开发的SSR标记中,单核苷酸重复序列最多,占42.15%,二核苷酸和三核苷酸序列也较丰富,分别占14.80%和16.74%;3)利用Primer3.0软件设计了与木质素合成酶基因及MYB转录因子相关的880对引物,随机选取29对引物,以8份不同类型黄麻种质进行多态性验证,获得8对具有稳定多态性的引物,多态性引物比率为27.58%。结果表明,基于黄麻转录组序列的SSR标记开发是可行的,开发的SSR标记可为黄麻属遗传多样性分析、遗传图谱构建及功能基因的挖掘等研究提供有利工具。
Keyword ：
SSR分子标记 SSR分子标记 开发 开发 转录组 转录组 黄麻 黄麻
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| GB/T 7714 | 陶爱芬 , 陈婉婷 , 祁建民 et al. 基于转录组测序的黄麻SSR分子标记开发与初步验证 [J]. | 中国农业大学学报 , 2018 , 23 (06) : 24-32 . |
| MLA | 陶爱芬 et al. "基于转录组测序的黄麻SSR分子标记开发与初步验证" . | 中国农业大学学报 23 . 06 (2018) : 24-32 . |
| APA | 陶爱芬 , 陈婉婷 , 祁建民 , 徐建堂 , 林荔辉 , 林培清 et al. 基于转录组测序的黄麻SSR分子标记开发与初步验证 . | 中国农业大学学报 , 2018 , 23 (06) , 24-32 . |
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Abstract ：
为筛选出与黄麻炭疽病抗性相关的新型分子标记,本研究在前期黄麻炭疽病抗性QTL定位结果的基础上,开发出7对可能与黄麻炭疽病抗性基因连锁的新型SNP标记.同时,在前期对重组自交系群体进行田间炭疽病抗性鉴定的基础上,分别以6个抗病株系和6个感病株系的基因组DNA构建了抗池和感池.以抗、感池的DNA为模板,对36对SSR引物和7对SNP引物进行了多态性筛选,从中初步筛选出具有多态性的SSR引物15对,SNP引物2对.继而,分别以12份抗病和感病株系的基因组DNA为模板,对上述具有多态性的SSR和SNP引物进行进一步验证,最终获得1对与黄麻炭疽病抗性相关的SNP标记,其产生的多态性片段大小约为600 bp.
Keyword ：
SNP SNP SSR SSR 抗性鉴定 抗性鉴定 炭疽病 炭疽病 黄麻 黄麻
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| GB/T 7714 | 陶爱芬 , 谢丽丽 , 祁建民 et al. 与黄麻炭疽病抗性相关的SSR分子标记筛选及新型SNP标记开发 [J]. | 福建农林大学学报(自然科学版) , 2017 , 46 (01) : 27-33 . |
| MLA | 陶爱芬 et al. "与黄麻炭疽病抗性相关的SSR分子标记筛选及新型SNP标记开发" . | 福建农林大学学报(自然科学版) 46 . 01 (2017) : 27-33 . |
| APA | 陶爱芬 , 谢丽丽 , 祁建民 , 方平平 , 林荔辉 , 徐建堂 et al. 与黄麻炭疽病抗性相关的SSR分子标记筛选及新型SNP标记开发 . | 福建农林大学学报(自然科学版) , 2017 , 46 (01) , 27-33 . |
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Abstract ：
黄麻的株高、茎粗及生育期等性状与产量密切相关,因此,研究黄麻主要农艺性状的相关性对黄麻高产优质新品种的选育具有重要意义。试验以来自不同国家和地区的32份黄麻种质为材料,对黄麻株高、茎粗、单株鲜皮重、生物学产量等农艺性状和工艺成熟期等生育期表现进行相关性分析和差异性评价。结果表明:黄麻的株高、茎粗、生育期与生物学产量之间均呈显著正相关;不同黄麻种质各性状的差异性明显,品种间变异系数在8.30%~21.39%之间;综合来看,梅峰6号、梅峰7号、闽麻5号、新选1号、黄麻179和D154等为综合性状优良的品种。研究结果为高产优质黄麻新品种的选育和实现黄麻的丰产稳产栽培提供了理论依据。
Keyword ：
农艺性状 农艺性状 差异性 差异性 生育期 生育期 相关性 相关性 黄麻 黄麻
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| GB/T 7714 | 陶爱芬 , 林培清 , 蔡梦容 et al. 32份黄麻品种主要农艺性状相关性分析及差异性评价 [J]. | 中国麻业科学 , 2017 , 39 (06) : 298-305,311 . |
| MLA | 陶爱芬 et al. "32份黄麻品种主要农艺性状相关性分析及差异性评价" . | 中国麻业科学 39 . 06 (2017) : 298-305,311 . |
| APA | 陶爱芬 , 林培清 , 蔡梦容 , 陈婉婷 , 方平平 , 林荔辉 et al. 32份黄麻品种主要农艺性状相关性分析及差异性评价 . | 中国麻业科学 , 2017 , 39 (06) , 298-305,311 . |
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Abstract ：
本发明提供一种光钝感耐盐碱抗病红麻品种的选育方法，属于红麻抗逆抗病育种技术领域，以红麻国审高产品种福红9921为轮回亲本，以光钝感红麻赞引1号、高抗炭疽病品种新安无刺、高抗根结线虫病品种ZHKX‑01、耐盐碱品种金航25为抗源抗逆亲本，采用同步回交和杂交聚合方法将4种主要的光周期不敏感基因、红麻抗病抗源基因、耐盐碱基因聚合导入到同一遗传背景的高产红麻品种中，育成同时具有光钝感特性、高抗炭疽病和根结线虫病且耐盐碱，其它农艺和产量性状与原轮回亲本高度一致的多抗、抗逆、光钝感、高产红麻新品种，增加产量，减少使用化学农药、降低了环境污染，同时不受不同维度地区的光周期影响，适合于盐碱地区种植推广。
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| GB/T 7714 | 徐建堂 , 祁建民 , 林培清 et al. 一种光钝感抗病耐盐碱红麻品种的选育方法 : CN201711461746.2[P]. | 2017-12-28 . |
| MLA | 徐建堂 et al. "一种光钝感抗病耐盐碱红麻品种的选育方法" : CN201711461746.2. | 2017-12-28 . |
| APA | 徐建堂 , 祁建民 , 林培清 , 方平平 , 林荔辉 , 陶爱芬 . 一种光钝感抗病耐盐碱红麻品种的选育方法 : CN201711461746.2. | 2017-12-28 . |
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Abstract ：
本发明提供一种多抗黄麻品种的选育方法，属于黄麻抗病育种技术领域。本方法以高产黄麻品种为轮回亲本，分别与抗炭疽病亲本、抗根结线虫病亲本、抗立枯病亲本杂交，先采用杂交‑回交方法将抗这3种主要黄麻病害的基因分别导入同一高产黄麻品种中，再通过杂交再复交方法将它们聚合到一起，育成能同时抗3种病害的黄麻品种。该方法育成的多抗黄麻品种抗性好，产量高，可显著减少农药的施用量，增加产量的同时还降低环境污染，每亩降低喷施农药及用工成本100‑120元，减轻农民投入，增加农民收益，降低环境污染。
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| GB/T 7714 | 徐建堂 , 林培清 , 祁建民 et al. 一种多抗黄麻品种的选育方法 : CN201711459633.9[P]. | 2017-12-28 . |
| MLA | 徐建堂 et al. "一种多抗黄麻品种的选育方法" : CN201711459633.9. | 2017-12-28 . |
| APA | 徐建堂 , 林培清 , 祁建民 , 方平平 , 林荔辉 , 陶爱芬 . 一种多抗黄麻品种的选育方法 : CN201711459633.9. | 2017-12-28 . |
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Abstract ：
Background: Genetic mapping and quantitative trait locus (QTL) detection are powerful methodologies in plant improvement and breeding. White jute (Corchorus capsularis L.) is an important industrial raw material fiber crop because of its elite characteristics. However, construction of a high-density genetic map and identification of QTLs has been limited in white jute due to a lack of sufficient molecular markers. The specific locus amplified fragment sequencing (SLAF-seq) strategy combines locus-specific amplification and high-throughput sequencing to carry out de novo single nuclear polymorphism (SNP) discovery and large-scale genotyping. In this study, SLAF-seq was employed to obtain sufficient markers to construct a high-density genetic map for white jute. Moreover, with the development of abundant markers, genetic dissection of fiber yield traits such as plant height was also possible. Here, we present QTLs associated with plant height that were identified using our newly constructed genetic linkage groups. Results: An F-8 population consisting of 100 lines was developed. In total, 69,446 high-quality SLAFs were detected of which 5,074 SLAFs were polymorphic; 913 polymorphic markers were used for the construction of a genetic map. The average coverage for each SLAF marker was 43-fold in the parents, and 9.8-fold in each F8 individual. A linkage map was constructed that contained 913 SLAFs on 11 linkage groups (LGs) covering 1621.4 cM with an average density of 1.61 cM per locus. Among the 11 LGs, LG1 was the largest with 210 markers, a length of 406.34 cM, and an average distance of 1.93 cM between adjacent markers. LG11 was the smallest with only 25 markers, a length of 29.66 cM, and an average distance of 1.19 cM between adjacent markers. 'SNP_only' markers accounted for 85.54% and were the predominant markers on the map. QTL mapping based on the F-8 phenotypes detected 11 plant height QTLs including one major effect QTL across two cultivation locations, with each QTL accounting for 4.14-15.63% of the phenotypic variance. Conclusions: To our knowledge, the linkage map constructed here is the densest one available to date for white jute. This analysis also identified the first QTL in white jute. The results will provide an important platform for gene/QTL mapping, sequence assembly, genome comparisons, and marker-assisted selection breeding for white jute.
Keyword ：
Corchorus capsularis L Corchorus capsularis L Genetic map Genetic map Plant height Plant height QTL QTL SLAF SLAF
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| GB/T 7714 | Tao, Aifen , Huang, Long , Wu, Guifen et al. High-density genetic map construction and QTLs identification for plant height in white jute (Corchorus capsularis L.) using specific locus amplified fragment (SLAF) sequencing [J]. | BMC GENOMICS , 2017 , 18 . |
| MLA | Tao, Aifen et al. "High-density genetic map construction and QTLs identification for plant height in white jute (Corchorus capsularis L.) using specific locus amplified fragment (SLAF) sequencing" . | BMC GENOMICS 18 (2017) . |
| APA | Tao, Aifen , Huang, Long , Wu, Guifen , Afshar, Reza Keshavarz , Qi, Jianmin , Xu, Jiantang et al. High-density genetic map construction and QTLs identification for plant height in white jute (Corchorus capsularis L.) using specific locus amplified fragment (SLAF) sequencing . | BMC GENOMICS , 2017 , 18 . |
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Abstract ：
光钝感杂交红麻的推广与应用是实现全球化红麻产业可持续发展的有效途径。总结了我国红麻研究现状及国际红麻产业发展趋势,探讨了我国光钝感杂交红麻的研究进展与应用意义。依托"一带一路"政策契机,开展红麻产业的国际合作是实现麻类产业转移,互惠共利的关键。
Keyword ：
“一带一路” “一带一路” 光钝感 光钝感 国际合作 国际合作 杂交红麻 杂交红麻
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| GB/T 7714 | 林荔辉 , 祁建民 , 徐建堂 et al. 光钝感杂交红麻研究现状及其国际化合作探究——基于“一带一路”战略模式 [J]. | 亚热带农业研究 , 2016 , 12 (03) : 145-150 . |
| MLA | 林荔辉 et al. "光钝感杂交红麻研究现状及其国际化合作探究——基于“一带一路”战略模式" . | 亚热带农业研究 12 . 03 (2016) : 145-150 . |
| APA | 林荔辉 , 祁建民 , 徐建堂 , 陶爱芬 , 方平平 , 张立武 et al. 光钝感杂交红麻研究现状及其国际化合作探究——基于“一带一路”战略模式 . | 亚热带农业研究 , 2016 , 12 (03) , 145-150 . |
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Abstract ：
麻类作物是世界上重要的纤维作物,也是我国最古老的作物之一,在国民经济中占有重要的地位。了解麻类作物是在何时、何地、由何种野生植物驯化而来,又是如何演化的,对于收集种质资源、制订品种改良策略具有重要意义。本文综述了我国栽培的苎麻、亚麻、黄麻、大麻和红麻等主要麻类作物的起源和演化,对其起源地、起源时间和演化路线等进行了概述,并对今后的研究方向进行了展望,以期为我国主要麻类作物的种质资源收集和品种改良等提供理论依据。
Keyword ：
演化 演化 起源 起源 麻类作物 麻类作物
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| GB/T 7714 | 陶爱芬 , 祁建民 , 林荔辉 et al. 中国主要麻类作物的起源与演化概述 [J]. | 中国麻业科学 , 2016 , 38 (03) : 136-142 . |
| MLA | 陶爱芬 et al. "中国主要麻类作物的起源与演化概述" . | 中国麻业科学 38 . 03 (2016) : 136-142 . |
| APA | 陶爱芬 , 祁建民 , 林荔辉 , 方平平 , 徐建堂 , 林培清 et al. 中国主要麻类作物的起源与演化概述 . | 中国麻业科学 , 2016 , 38 (03) , 136-142 . |
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Abstract ：
为明确外源硒及脯氨酸(Pro)对菜用黄麻生长和生理特性的影响,本研究以新型菜用黄麻品种福农1号为材料,测定了在水培液中添加不同浓度的硒(0、0.2、0.5、1.0、2.5、5.0 mg/L)与脯氨酸(50μmol/L)对菜用黄麻苗期生长、叶绿素、渗透调节物质及抗氧化酶活性的影响。结果表明:(1)外源硒浓度≤0.5 mg/L时,能促进菜用黄麻的株高、根长、株重及根重,而外源硒浓度≥2.5 mg/L时则会对其生长产生抑制和毒害作用;浓度为0.2 mg/L的硒最有利于菜用黄麻福农1号苗期的生长发育;硒浓度较低时,外源脯氨酸具有促进菜用黄麻生长的作用,而硒浓度较高时,脯氨酸可缓解硒对菜用黄麻生长的抑制。(2)外源硒可促进菜用黄麻中叶绿素的合成,亦能促进游离脯氨酸、可溶性糖和可溶性蛋白等渗透调节物质的形成,并且随硒浓度增加呈现先升高后降低的变化趋势;硒浓度为0.5和1.0 mg/L时,可最大程度地促进菜用黄麻叶绿素和渗透调节物质的合成;外源脯氨酸亦具有促进菜用黄麻叶绿素和渗透调节物质合成的功能,并且对高浓度硒造成的毒害有一定的缓解作用。(3)中低浓度的硒(0.5和1.0 mg/L)明显促进菜用黄麻超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)和谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-Px)等抗氧化酶的活性,而高浓度硒(5.0 mg/L)抑制菜用黄麻抗氧化酶的活性;随外源硒浓度增加,菜用黄麻抗氧化酶活性呈先升高后降低的趋势;外源脯氨酸能促进菜用黄麻抗氧化酶的活性,硒浓度为2.5和5.0 mg/L时,添加脯氨酸的处理POD、SOD和CAT活性高于未添加者,表明脯氨酸具有增强菜用黄麻抵抗力和自由基清除的能力,从而可以缓解高浓度硒的胁迫。以上结论对菜用黄麻这一新型蔬菜的生产具有重要的理论和实践意义。
Keyword ：
生理特性 生理特性 生长 生长 硒 硒 脯氨酸 脯氨酸 菜用黄麻 菜用黄麻
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| GB/T 7714 | 陶爱芬 , 陈娴娴 , 祁建民 et al. 外源硒及脯氨酸对菜用黄麻生长和生理特性的影响 [J]. | 中国麻业科学 , 2015 , 37 (05) : 239-245 . |
| MLA | 陶爱芬 et al. "外源硒及脯氨酸对菜用黄麻生长和生理特性的影响" . | 中国麻业科学 37 . 05 (2015) : 239-245 . |
| APA | 陶爱芬 , 陈娴娴 , 祁建民 , 方平平 , 林荔辉 , 徐建堂 et al. 外源硒及脯氨酸对菜用黄麻生长和生理特性的影响 . | 中国麻业科学 , 2015 , 37 (05) , 239-245 . |
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Abstract ：
以珍汕97B/秀水13的系列F7代株系为材料,在程氏籼粳分类与SSR分子聚类分析的基础上,鉴定了籼粳交后代株系在两种不同温度下的花粉黑染率与结实率的稳定性。结果表明,F7代株系的籼粳属性发生明显分离,以偏籼型比例最大,占47.7%;SSR分子聚类在遗传相似系数为0.54处将籼粳交后代大致分成籼、粳两大类群;SSR分子聚类结果与程氏籼粳分类结果基本吻合,相符度达85.4%。籼粳交后代花粉黑染率与结实率易受低温影响,育性下降,且变异系数大。根据育性表型可筛选出育性稳定的株系作为籼粳交育种材料。
Keyword ：
水稻 水稻 程氏分类 程氏分类 籼粳交 籼粳交 聚类分析 聚类分析 育性稳定性 育性稳定性
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| GB/T 7714 | 林荔辉 , 吴建梅 , 林培清 et al. 籼粳交后代的籼粳分类及育性稳定性分析 [J]. | 亚热带农业研究 , 2015 , 11 (03) : 145-150 . |
| MLA | 林荔辉 et al. "籼粳交后代的籼粳分类及育性稳定性分析" . | 亚热带农业研究 11 . 03 (2015) : 145-150 . |
| APA | 林荔辉 , 吴建梅 , 林培清 , 祁建民 . 籼粳交后代的籼粳分类及育性稳定性分析 . | 亚热带农业研究 , 2015 , 11 (03) , 145-150 . |
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