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学者姓名：林彦铨
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为丰富甘蔗花叶病毒(Sugarcane mosaic virus,SCMV)种群信息,探索SCMV种群结构,本研究运用RT-PCR方法克隆了采自福州的2个SCMV分离物(分别命名为FZ-C1和FZ-C2)的全基因组,结合已公布的18个SCMV分离物的全基因组序列,利用MEGA 4.1和Simplot软件对SCMV的种群结构进行了分析。结果显示,FZ-C1和FZ-C2全长分别为9 570nt和9 573 nt,均包含一个9 189 nt的开放阅读框,编码长度为3 063个氨基酸的多聚蛋白。这2个分离物与SCM V-A株系的相似性最高,酶切位点也与SCMV-A株系的基本一致。系统发育进化分析表明,SCMV可以分为3组,分别命名为SSGⅠ、Ⅱ、Ⅲ。SSGⅠ来源于玉米(Zea mays),SSGⅡ和SSGⅢ来源于甘蔗(Saccharum spp.hybrid),其中SSGⅢ主要来源于果蔗。FZ分离物聚在SSGⅡ组内。研究结果丰富了SCMV全基因组序列信息,有助于全面了解SCMV种群的遗传进化关系。
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全基因组 全基因组 甘蔗 甘蔗 甘蔗花叶病毒 甘蔗花叶病毒 进化分析 进化分析
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| GB/T 7714 | 邓宇晴 , 杨永庆 , 翟玉山 et al. 甘蔗花叶病毒福州分离物全基因组克隆及种群分析 [J]. | 植物病理学报 , 2016 , 46 (06) : 775-782 . |
| MLA | 邓宇晴 et al. "甘蔗花叶病毒福州分离物全基因组克隆及种群分析" . | 植物病理学报 46 . 06 (2016) : 775-782 . |
| APA | 邓宇晴 , 杨永庆 , 翟玉山 , 程光远 , 彭磊 , 郑艳茹 et al. 甘蔗花叶病毒福州分离物全基因组克隆及种群分析 . | 植物病理学报 , 2016 , 46 (06) , 775-782 . |
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Abstract ：
生长素结合蛋白(auxin binding protein,ABP)在生长素信号转导、植物生长发育调控等方面发挥重要作用。该研究利用RT-PCR方法从甘蔗品种Badila中克隆得到了1个ABP基因,序列分析显示该基因的开放读码框(ORF)长度为615bp,编码204个氨基酸。多序列比对和系统进化树分析表明它与高粱(Sorghum bicolor)和玉米(Zea mays)的ABP4蛋白的亲缘关系最近,因此将该基因命名为ScABP4。将其构建到原核表达载体pGEX-6P-1中,成功表达出一个分子量约为22.5kD的蛋白。亚细胞定位结果显示ScABP4主要定位于细胞质网状结构和细胞膜;生物信息学分析显示ScABP4是一个带有信号肽的分泌蛋白,说明ScABP4蛋白可能储存在内质网中并在质膜上执行其生物学功能。荧光定量PCR分析结果表明,ScABP4基因在甘蔗的芽、根、茎、叶中均有表达,其中在芽中相对表达量最高。生长素和黑暗处理下ScABP4基因的表达上调,说明ScABP4基因可能参与甘蔗对生长素的响应及与光信号通路的互作。此外,ABA、JA、SA、CuCl2胁迫能够诱导ScABP4基因的表达,CdCl_2胁迫可抑制ScABP4的表达。由此推测,ScABP4基因可能参与甘蔗对病害、干旱、渗透、重金属等胁迫的应答过程。该研究结果为探讨甘蔗生长素结合蛋白基因的功能提供了实验证据。
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同源克隆 同源克隆 甘蔗 甘蔗 生长素结合蛋白 生长素结合蛋白 表达分析 表达分析
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| GB/T 7714 | 邓宇晴 , 翟玉山 , 彭磊 et al. 甘蔗生长素结合蛋白ScABP4基因的克隆与表达 [J]. | 西北植物学报 , 2016 , 36 (05) : 865-873 . |
| MLA | 邓宇晴 et al. "甘蔗生长素结合蛋白ScABP4基因的克隆与表达" . | 西北植物学报 36 . 05 (2016) : 865-873 . |
| APA | 邓宇晴 , 翟玉山 , 彭磊 , 董萌 , 徐倩 , 程光远 et al. 甘蔗生长素结合蛋白ScABP4基因的克隆与表达 . | 西北植物学报 , 2016 , 36 (05) , 865-873 . |
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Abstract ：
对3个甘蔗与斑茅远缘杂交后代BC1进行真实性鉴定及染色体核型分析,以探讨甘蔗与斑茅BC1的染色体传递方式。利用2对鉴定斑茅真实杂交后代的特异引物对3个甘蔗与斑茅BC1进行鉴定,采用根尖分生区细胞去壁低渗涂片法制片,显微拍照计数染色体数目,并进行染色体核型分析。3个BC1材料均为斑茅的真实杂交后代,崖城01-69体细胞染色体核型公式为2n=121=120 m+1 sm,其染色体按2n+n方式传递;崖城01-116的体细胞染色体核型公式为2n=122=118 m+4 sm,其染色体传递方式为2n+n;崖城01-134的体细胞染色体核型公式为2n=121=120 m+1 sm,其染色体传递为2n+n。推断甘蔗与斑茅BC1的染色体以2n+n的方式传递。
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斑茅 斑茅 染色体传递方式 染色体传递方式 核型分析 核型分析 甘蔗 甘蔗
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| GB/T 7714 | 黄永吉 , 符成 , 林炜乐 et al. 3个甘蔗与斑茅远缘杂交后代BC_1的染色体遗传分析 [J]. | 热带作物学报 , 2015 , 36 (01) : 53-58 . |
| MLA | 黄永吉 et al. "3个甘蔗与斑茅远缘杂交后代BC_1的染色体遗传分析" . | 热带作物学报 36 . 01 (2015) : 53-58 . |
| APA | 黄永吉 , 符成 , 林炜乐 , 刘少谋 , 高嘉慧 , 邓祖湖 et al. 3个甘蔗与斑茅远缘杂交后代BC_1的染色体遗传分析 . | 热带作物学报 , 2015 , 36 (01) , 53-58 . |
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Abstract ：
Erianthus arundinaceus (E. arundinaceus) has many desirable agronomic traits for sugarcane improvement, such as high biomass, vigor, rationing ability, tolerance to drought, and water logging, as well as resistance to pests and disease. To investigate the introgression of the E. arundinaceus genome into sugarcane in the higher generations, intergeneric BC2 and BC3 progeny generated between Saccharum spp. and E. arundinaceus were studied using the genomic in situ hybridization (GISH) technique. The results showed that the BC2 and BC3 generations resulted from n + n chromosome transmission. Furthermore, chromosome translocation occurred at terminal fragments from the E. arundinaceus chromosome in some progeny of Saccharum spp. and E. arundinaceus. Notably, the translocated chromosomes could be stably transmitted to their progeny. This study illustrates the characterization of chromosome inheritance of the intergeneric BC2 and BC3 progeny between Saccharum spp. and E. arundinaceus. This work could provide more useful molecular cytogenetic information for the germplasm resources of E. arundinaceus, and may promote further understanding of the germplasm resources of E. arundinaceus for sugarcane breeders to accelerate its progress in sugarcane commercial breeding.
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| GB/T 7714 | Huang, Yongji , Wu, Jiayun , Wang, Ping et al. Characterization of Chromosome Inheritance of the Intergeneric BC2 and BC3 Progeny between Saccharum spp. and Erianthus arundinaceus [J]. | PLOS ONE , 2015 , 10 (7) . |
| MLA | Huang, Yongji et al. "Characterization of Chromosome Inheritance of the Intergeneric BC2 and BC3 Progeny between Saccharum spp. and Erianthus arundinaceus" . | PLOS ONE 10 . 7 (2015) . |
| APA | Huang, Yongji , Wu, Jiayun , Wang, Ping , Lin, Yanquan , Fu, Cheng , Deng, Zuhu et al. Characterization of Chromosome Inheritance of the Intergeneric BC2 and BC3 Progeny between Saccharum spp. and Erianthus arundinaceus . | PLOS ONE , 2015 , 10 (7) . |
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Abstract ：
甘蔗(Saccharum spp.)是我国乃至世界最重要的糖料作物和高效的第一代可再生生物燃料作物。现代甘蔗栽培品种是遗传背景复杂的异源多倍体植物,主要来源于热带种(S.officinarum)和割手密(S.spontaneum)的种间杂交后代。然而,由于亲本遗传基础狭窄,异质性低,限制了甘蔗产量的提高。因此,有必要通过远缘杂交的方法导入近缘属野生种质资源来拓宽甘蔗遗传基础。斑茅(Erianthus arundinaceus)是极其重要的甘蔗近缘属植物之一,因其具有高生物量、生势旺盛、分蘖力强、宿根性好和耐涝、耐瘠、抗旱、抗病虫能力强等优异性状,蕴藏着丰富的基因资源,备受甘蔗育种者亲睐,成为各国甘蔗育种者竞相杂交利用的野生种质。目前,已突破其F_1的难题,成功地将斑茅血缘渗透到甘蔗中,获得一批高世代回交后代。为了解斑茅种质渗透到甘蔗中的情况,以及甘蔗与斑茅杂交后代的染色体遗传,本研究通过基因组原位杂交的方法对甘蔗与斑茅杂交后代的染色体遗传进行研究发现:(1)5个甘蔗与斑茅的F_1染色体数目都在68~69条之间,来自甘蔗热带种Badila(2n=80)的染色体数为40条,来自斑茅(2n=60)的染色体数为28~29条,以n+n的方式遗传;(2)甘蔗与斑茅的F_1与甘蔗栽培品种CP84-1198(2n=120)杂交产生的13个BC_1的染色体数目在120~130条之间,其中,其斑茅染色体的数目在22~35条之间,而其母本的斑茅染色体数目在28~29条之间,染色体遗传复杂,9个甘蔗与斑茅的BC_1的染色体以2n+n的方式遗传,4个甘蔗与斑茅的BC_1的染色体以超2n+n的方式遗传;(3)甘蔗与斑茅的BC_2、BC_3和BC_4随着回交世代的增加,斑茅染色体数目逐代减半,均是以n+n的方式遗传。然而,有一个甘蔗与斑茅的BC_3无性系材料YCE05-164的染色体遗传方式较特殊,虽然其染色体是以n+n的方式遗传,但其斑茅染色体数目超过其父本YCE03-16,可能是因其父本YCE03-16在减数分裂时甘蔗染色体和斑茅染色体分离不同步所致;(4)在37个甘蔗与斑茅的杂交后代中发现有8个材料的染色体有易位的现象,BC_1有2个,BC_2有2个,BC_3有4个,按系谱来看,这种易位是可以遗传的,如YCE01-92是YCE03-378的父本,YCE03-168是YCE06-111的母本。本研究阐明了甘蔗与斑茅的杂交后代的染色体遗传特点以及是否发生甘蔗与斑茅的染色体交换等行为的问题,为斑茅种质资源的深入研究提供更多的分子细胞遗传学信息,有助于甘蔗育种者进一步了解斑茅种质资源并加快斑茅种质资源在甘蔗商业化育种的进程。
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斑茅 斑茅 染色体易位 染色体易位 染色体遗传 染色体遗传 甘蔗 甘蔗 超2n+n 超2n+n
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| GB/T 7714 | 黄永吉 , 吴嘉云 , 邓祖湖 et al. 甘蔗与斑茅杂交后代的染色体遗传研究 [C] //2014年中国作物学会学术年会论文集 . 2014 . |
| MLA | 黄永吉 et al. "甘蔗与斑茅杂交后代的染色体遗传研究" 2014年中国作物学会学术年会论文集 . (2014) . |
| APA | 黄永吉 , 吴嘉云 , 邓祖湖 , 林彦铨 , 符成 , 刘少谋 et al. 甘蔗与斑茅杂交后代的染色体遗传研究 2014年中国作物学会学术年会论文集 . (2014) . |
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Abstract ：
Erianthus arundinaceus is a valuable source of agronomic traits for sugarcane improvement such as ratoonability, biomass, vigor, tolerance to drought and water logging, as well as resistance to pests and disease. To investigate the introgression of the E. arundinaceus genome into sugarcane, five intergeneric F-1 hybrids between S. officinarum and E. arundinaceus and 13 of their BC1 progeny were studied using the genomic in situ hybridization (GISH) technique. In doing so, we assessed the chromosome composition and chromosome transmission in these plants. All F-1 hybrids were aneuploidy, containing either 28 or 29 E. arundinaceus chromosomes. The number of E. arundinaceus chromosomes in nine of the BC1 progeny was less than or equal to 29. Unexpectedly, the number of E. arundinaceus chromosomes in the other four BC1 progeny was above 29, which was more than in their F-1 female parents. This is the first cytogenetic evidence for an unexpected inheritance pattern of E. arundinaceus chromosomes in sugarcane. We pointed to several mechanisms that may be involved in generating more than 2n gametes in the BC1 progeny. Furthermore, the implication of these results for sugarcane breeding programs was discussed.
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| GB/T 7714 | Wu, Jiayun , Huang, Yongji , Lin, Yanquan et al. Unexpected Inheritance Pattern of Erianthus arundinaceus Chromosomes in the Intergeneric Progeny between Saccharum spp. and Erianthus arundinaceus [J]. | PLOS ONE , 2014 , 9 (10) . |
| MLA | Wu, Jiayun et al. "Unexpected Inheritance Pattern of Erianthus arundinaceus Chromosomes in the Intergeneric Progeny between Saccharum spp. and Erianthus arundinaceus" . | PLOS ONE 9 . 10 (2014) . |
| APA | Wu, Jiayun , Huang, Yongji , Lin, Yanquan , Fu, Cheng , Liu, Shaomou , Deng, Zuhu et al. Unexpected Inheritance Pattern of Erianthus arundinaceus Chromosomes in the Intergeneric Progeny between Saccharum spp. and Erianthus arundinaceus . | PLOS ONE , 2014 , 9 (10) . |
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Abstract ：
甘蔗黄叶病是一种发生普遍、危害严重的病毒病害,选育抗病品种是控制该病发生与蔓延的有效措施.利用逆转录一聚合酶链反应(RT-PCR)、组织印迹杂交免疫测定(TBIA)和抗原直接包被酶联免疫吸附(DAC-ELISA)方法对我国43份甘蔗主要杂交亲本黄叶病病原(Sugarcane yellow leaf virus,SCYLV)进行鉴定,并调查SCYLV田间自然侵染条件下甘蔗黄叶病发病率.已明确36份亲本材料感染或未感染SCYLV,其中32份鉴定结果为阳性,品种(系)感病率达88.9％.甘蔗植株田间自然发病率可分为无发病、发病率低、中等和高4个等级,方差分析表明,各等级间的植株发病率差异达极显著水平(P＜0.01).从美国引进的多数CP和HoCP系列亲本发病率较高,而多数崖城和新台糖系列亲本材料的发病率较低,可作为甘蔗抗黄叶病杂交亲本.
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亲本材料 亲本材料 甘蔗 甘蔗 田间发病率 田间发病率 病原鉴定 病原鉴定 黄叶病毒 黄叶病毒
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| GB/T 7714 | 高三基 , 林彦铨 , 邓祖湖 et al. 我国甘蔗主要杂交亲本黄叶病病原鉴定及田间发病率 [C] //中国作物学会甘蔗专业委员会第15次学术研讨会论文集 . 2014 : 113-119 . |
| MLA | 高三基 et al. "我国甘蔗主要杂交亲本黄叶病病原鉴定及田间发病率" 中国作物学会甘蔗专业委员会第15次学术研讨会论文集 . (2014) : 113-119 . |
| APA | 高三基 , 林彦铨 , 邓祖湖 , 徐良年 , 陈如凯 . 我国甘蔗主要杂交亲本黄叶病病原鉴定及田间发病率 中国作物学会甘蔗专业委员会第15次学术研讨会论文集 . (2014) : 113-119 . |
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Abstract ：
以45个家系甘蔗实生苗为供试材料,对蔗茎产量、甘蔗蔗糖分、有效茎、茎径、株高、甘蔗纤维分6个影响甘蔗产业经济效益最大的主要数量性状进行了经济遗传值(经济育种值)分析,结果表明:29个母本中,粤农73-204、德蔗93-88、CP84-1198、粤糖85-177、HoCP93-746、桂糖96-44、云蔗89-351、CP88-2143和湛蔗74-141等经济育种值高;26个父本中,CP84-1198、福农91-4621、粤糖89-240、CP81-1254、桂糖00-122、云瑞99-601、云瑞05-808、云瑞03-806、ROC22和福农95-1702等经济育种值高;45个家系中粤农73-204xCP84-1198、福农91-4710×粤糖89-240、HoCP93-746×福农91-4621、CP84-1198×ROC22、粤糖91-976×CP84-1198、HoCP93-746×ROC22,CP88-2143×粤糖97-76、桂糖96-44xROClO、云蔗89-35lxCP84-1198、湛蔗74-14lxCP81-1254、HoCP93-746x湛蔗74-141、德蔗93-88x云瑞99-601、ROC11x桂糖91-116等经济遗传值高,可作为选育甘蔗新品种的重点家系.
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亲本评价 亲本评价 品种选育 品种选育 家系经济遗传值 家系经济遗传值 甘蔗 甘蔗
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| GB/T 7714 | 徐良年 , 邓祖湖 , 林彦铨 et al. 经济遗传值在甘蔗选育种应用研究系列(三)甘蔗亲本经济育种值和家系经济遗传值分析 [C] //中国作物学会甘蔗专业委员会第15次学术研讨会论文集 . 2014 : 1-4 . |
| MLA | 徐良年 et al. "经济遗传值在甘蔗选育种应用研究系列(三)甘蔗亲本经济育种值和家系经济遗传值分析" 中国作物学会甘蔗专业委员会第15次学术研讨会论文集 . (2014) : 1-4 . |
| APA | 徐良年 , 邓祖湖 , 林彦铨 , 陈如凯 , 傅华英 . 经济遗传值在甘蔗选育种应用研究系列(三)甘蔗亲本经济育种值和家系经济遗传值分析 中国作物学会甘蔗专业委员会第15次学术研讨会论文集 . (2014) : 1-4 . |
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Abstract ：
高效的杂交体系是利用荧光原位杂交技术进行相关研究的基础。本研究对影响甘蔗染色体荧光原位杂交效果的关键因素如染色体预处理、变性条件和变性方式等进行筛选,优化适合于甘蔗的荧光原位杂交体系。本研究以甘蔗(Saccharum officinarum)与斑茅(Erianthus arundinaceus)F1崖城96-66的根尖为材料,采用对二氯苯离体、α-溴代萘离体和4℃低温水中非离体3种预处理方法,筛选染色体形态,采用分开变性和共变性两种变性方式并结合筛选合适的变性温度(设置70、80、90和98℃共变性与60、70、80和90℃分开变性),比较其杂交信号效果。结果表明,采用对二氯苯离体预处理,染色体形态呈粗短型,适用于以甘蔗基因组原位杂交计数来探讨染色体遗传模式的研究;采用α-溴代萘离体预处理和4℃低温水中非离体预处理,染色体形态较长,缢痕较明显,适用于染色体基因定位和核型分析等研究;80℃共变性和70~80℃的温度范围分开变性的杂交效果较佳;据筛选结果采用探针和染色体分开变性,染色体变性温度为80℃优化基因组原位杂交的体系来检验效果,α-溴代萘饱和水溶液预处理后所得的染色体较为分散,形态相对较长,45S rDNA定位信号强且分辨率高;对二氯苯饱和水溶液预处理后所得的染色体分散,形态较短小,荧光信号均一,说明优化的体系效果好。本研究为进一步开展相关的染色体荧光原位杂交提供技术平台,为甘蔗近缘属野生种质利用提供技术支撑,为远缘杂交后代材料的分子细胞遗传学深入研究提供基础资料。
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变性 变性 斑茅 斑茅 甘蔗 甘蔗 荧光原位杂交 荧光原位杂交 预处理 预处理
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| GB/T 7714 | 吴嘉云 , 黄永吉 , 邓祖湖 et al. 甘蔗与斑茅后代荧光原位杂交体系优化 [J]. | 农业生物技术学报 , 2013 , 21 (11) : 1279-1286 . |
| MLA | 吴嘉云 et al. "甘蔗与斑茅后代荧光原位杂交体系优化" . | 农业生物技术学报 21 . 11 (2013) : 1279-1286 . |
| APA | 吴嘉云 , 黄永吉 , 邓祖湖 , 林彦铨 , 陈如凯 . 甘蔗与斑茅后代荧光原位杂交体系优化 . | 农业生物技术学报 , 2013 , 21 (11) , 1279-1286 . |
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Abstract ：
本研究以甘蔗与斑茅杂交后代为材料,利用人工接种花叶病毒和黑穗病菌,人工水分胁迫,初步评价甘蔗和斑茅杂交后代的抗花叶病、抗黑穗病和抗旱性表现.结果表明:不同的甘蔗与斑茅杂交后代抗黑穗病、抗花叶病和抗旱表现分离.初步评价出了甘蔗与斑茅杂交后代BC1YCE01-134和YCE01-116,其对花叶病和黑穗病表现"0"感染率且抗旱性生理指标良好,有望成为供甘蔗育种利用的高抗的抗源亲本.
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抗旱 抗旱 抗病 抗病 斑茅 斑茅 甘蔗 甘蔗 评价 评价
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| GB/T 7714 | 吴嘉云 , 刘少谋 , 邓祖湖 et al. 甘蔗与斑茅若干杂交后代抗性初步评价 [J]. | 福建农林大学学报(自然科学版) , 2013 , 42 (06) : 565-569 . |
| MLA | 吴嘉云 et al. "甘蔗与斑茅若干杂交后代抗性初步评价" . | 福建农林大学学报(自然科学版) 42 . 06 (2013) : 565-569 . |
| APA | 吴嘉云 , 刘少谋 , 邓祖湖 , 杨川毓 , 廖振阳 , 符成 et al. 甘蔗与斑茅若干杂交后代抗性初步评价 . | 福建农林大学学报(自然科学版) , 2013 , 42 (06) , 565-569 . |
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