Query：
学者姓名：魏道智
Refining：
Year
Type
Indexed by
Source
Complex
Co-Author
Language
Clean All
Abstract ：
本研究利用Illumina HiSeq对建泽泻、川泽泻、窄叶泽泻进行了高通量测序，获得124 452条unigenes，采用MIcroSAtellite (MISA)软件对所获得的unigene进行SSR位点检测和分析，发现13 785个SSR位点分布在10 519条unigenes中，分布频率为11.08%。泽泻转录组中以单、二、三核苷酸为主要重复类型，分别占比SSR总数量的33.48%、28.32%和35.57%，优势重复基元为A/T、AG/CT、AAG/CTT，占比26.99%、13.07%、4.92%，其余重复类型相对较少。SSR重复次数以5～12次重复为主，基序长度集中在10～20 bp，所占比例为84.99%。对SSR所在序列进行GO功能注释，结果显示，有6 374条序列获得了GO注释，其中生物过程涉及的GO Term最多，有19个。转录组测序结果表明，泽泻SSR数量及类型较为丰富，可为后续泽泻SSR分子标记开发、种质资源鉴定、分子辅助育种以及遗传多样性分析等方面提供参考依据。
Keyword ：
SSR SSR 泽泻 泽泻 转录组 转录组
Cite：
Copy from the list or Export to your reference management。
| GB/T 7714 | 秦霞 , 林文津 , 文香月 et al. 泽泻转录组SSR位点信息分析 [J]. | 分子植物育种 , 2025 , 23 (07) : 2358-2363 . |
| MLA | 秦霞 et al. "泽泻转录组SSR位点信息分析" . | 分子植物育种 23 . 07 (2025) : 2358-2363 . |
| APA | 秦霞 , 林文津 , 文香月 , 吴双双 , 徐榕青 , 魏道智 . 泽泻转录组SSR位点信息分析 . | 分子植物育种 , 2025 , 23 (07) , 2358-2363 . |
| Export to | NoteExpress RIS BibTex |
Version ：
Abstract ：
The Asian water plantain, Alisma orientale (Sam.) Juzep, is a traditional Chinese medicinal plant. The dried tubers of the Alisma orientale, commonly referred to as Alismatis rhizome (AR), have long been used in traditional Chinese medicine to treat a variety of diseases. Soil properties and the soil microbial composition are known to affect the quality and bioactivity of plants. Here, we sought to identify variations in soil fungal communities and soil properties to determine which would be optimal for cultivation of A. orietale. Soil properties, heavy metal content, and pesticide residues were determined from soils derived from four different agricultural regions around Shaowu City, Fujian, China, that had previously been cultivated with various crops, namely, Shui Dao Tu (SDT, rice), Guo Shu Tu (GST, pecan), Cha Shu Tu (CST, tea trees), and Sang Shen Tu (SST, mulberry). As fungi can either positively or negatively impact plant growth, the fungal communities in the different soils were characterized using long-read PacBio sequencing. Finally, we examined the quality of A. orientale grown in the different soils. Our results show that fungal community diversity of the GST soil was the highest with saprotrophs the main functional modes in these and SDT soils. Our data show that GST and SDT soils were most suitable for A. orientale growth, with the quality of the AR tubers harvested from GST soil being the highest. These data provide a systematic approach at soil properties of agricultural lands in need of replacement and/or rotating crops. Based on our findings, GST was identified as the optimal soil for planting A. orientale, providing a new resource for local farmers.
Keyword ：
Alisma orientale Alisma orientale Alismatis rhizome Alismatis rhizome chemical properties chemical properties heavy metal heavy metal PacBio sequencing PacBio sequencing pesticide residues pesticide residues soil fungal community soil fungal community
Cite：
Copy from the list or Export to your reference management。
| GB/T 7714 | Xu, Xiaomei , Lin, Wenjin , Keyhani, Nemat O. et al. Properties and Fungal Communities of Different Soils for Growth of the Medicinal Asian Water Plantain, Alisma orientale, in Fujian, China [J]. | JOURNAL OF FUNGI , 2024 , 10 (3) . |
| MLA | Xu, Xiaomei et al. "Properties and Fungal Communities of Different Soils for Growth of the Medicinal Asian Water Plantain, Alisma orientale, in Fujian, China" . | JOURNAL OF FUNGI 10 . 3 (2024) . |
| APA | Xu, Xiaomei , Lin, Wenjin , Keyhani, Nemat O. , Liu, Sen , Li, Lisha , Zhang, Yamin et al. Properties and Fungal Communities of Different Soils for Growth of the Medicinal Asian Water Plantain, Alisma orientale, in Fujian, China . | JOURNAL OF FUNGI , 2024 , 10 (3) . |
| Export to | NoteExpress RIS BibTex |
Version ：
Abstract ：
目的 采用流式细胞术测定马蓝基因组大小。方法 以马蓝幼嫩叶片为材料，水稻日本晴为参照，mGb裂解液解离细胞后通过流式细胞仪检测荧光强度，计算基因组大小。结果 mGb裂解液对细胞核解离效果较好，马蓝基因组大小为(0.99±0.01)Gb。结论 该方法既丰富了马蓝遗传信息，又为其基因组学研究和流式细胞技术应用提供参考。
Keyword ：
基因组大小 基因组大小 流式细胞术 流式细胞术 马蓝 马蓝
Cite：
Copy from the list or Export to your reference management。
| GB/T 7714 | 胡永乐 , 宁书菊 , 叶齐 et al. 流式细胞术测定马蓝基因组大小 [J]. | 中成药 , 2023 , 45 (02) : 634-636 . |
| MLA | 胡永乐 et al. "流式细胞术测定马蓝基因组大小" . | 中成药 45 . 02 (2023) : 634-636 . |
| APA | 胡永乐 , 宁书菊 , 叶齐 , 马小毛 , 蔡国倩 , 魏道智 . 流式细胞术测定马蓝基因组大小 . | 中成药 , 2023 , 45 (02) , 634-636 . |
| Export to | NoteExpress RIS BibTex |
Version ：
Abstract ：
以福建省安溪县为研究边界,选取了1999—2019年该县及所属乡镇的耕地、林地、草地、园地、水域、建设用地和未利用地等7个土地利用类型作为物种变量,与其相关性较大的社会经济指标为环境变量,采用典范对应分析和空间自相关等方法进行分析,以明确安溪县和所属乡镇的土地利用时空演变特征及其关键驱动因素。研究结果表明:安溪县1999—2019年间土地利用类型变化总体上呈"三减四增"态势,并在全局空间分布格局上呈明显的聚焦状态。全县耕地、草地和水域面积分别减少36.82%、22.91%和8.18%,而林地、园地(主要是茶园)、建设用地和未利用地面积则分别增加了10.37%、56.39%、206.08%和90.14%。就林地面积而言,近10年来安溪县24个乡镇中有1/3的乡镇林地呈下降趋势。其中,祥华、大坪、虎邱、参内、福田和城厢6个乡镇林地面积减少明显。研究表明:在县域水平上,主要土地利用类型变化,除了受地理因素的制约外,主要受社会经济指标和宏观政策的驱动因素调控。排位最大的前3个因素分别是社会消费品零售总额、地区生产总值和茶叶产量。在镇域水平上,不同乡镇由于地理条件,特别是城镇化水平和经济发展状况不同,其土地利用策略和发展驱动力也不同,但茶产业发展驱动仍是关键因素。根据土地利用现状与存在问题,提出应强化土地利用科学规划与有效整治,方可保证区域生态经济协调可持续发展。
Keyword ：
关键驱动因素 关键驱动因素 典范对应分析 典范对应分析 土地利用 土地利用 时空演变格局 时空演变格局 空间自相关 空间自相关
Cite：
Copy from the list or Export to your reference management。
| GB/T 7714 | 江文甲 , 林满红 , 翁佩莹 et al. 福建省安溪县土地利用时空演变规律及其关键驱动因素 [J]. | 生态学报 , 2022 , 42 (02) : 513-527 . |
| MLA | 江文甲 et al. "福建省安溪县土地利用时空演变规律及其关键驱动因素" . | 生态学报 42 . 02 (2022) : 513-527 . |
| APA | 江文甲 , 林满红 , 翁佩莹 , 庞孜钦 , 林文雄 , 魏道智 et al. 福建省安溪县土地利用时空演变规律及其关键驱动因素 . | 生态学报 , 2022 , 42 (02) , 513-527 . |
| Export to | NoteExpress RIS BibTex |
Version ：
Abstract ：
Strobilanthes cusia (Nees) Kuntze is an important plant used to process the traditional Chinese herbal medicines "Qingdai" and "Nanbanlangen". The key active ingredients are indole alkaloids (IAs) that exert antibacterial, antiviral, and antitumor pharmacological activities and serve as natural dyes. We assembled the S. cusia genome at the chromosome level through combined PacBio circular consensus sequencing (CCS) and Hi-C sequencing data. Hi-C data revealed a draft genome size of 913.74 Mb, with 904.18 Mb contigs anchored into 16 pseudo-chromosomes. Contig N50 and scaffold N50 were 35.59 and 68.44 Mb, respectively. Of the 32,974 predicted protein-coding genes, 96.52% were functionally annotated in public databases. We predicted 675.66 Mb repetitive sequences, 47.08% of sequences were long terminal repeat (LTR) retrotransposons. Moreover, 983 Strobilanthes-specific genes (SSGs) were identified for the first time, accounting for similar to 2.98% of all protein-coding genes. Further, 245 putative centromeric and 29 putative telomeric fragments were identified. The transcriptome analysis identified 2,975 differentially expressed genes (DEGs) enriched in phenylpropanoid, flavonoid, and triterpenoid biosynthesis. This systematic characterization of key enzyme-coding genes associated with the IA pathway and basic helix-loop-helix (bHLH) transcription factor family formed a network from the shikimate pathway to the indole alkaloid synthesis pathway in S. cusia. The high-quality S. cusia genome presented herein is an essential resource for the traditional Chinese medicine genomics studies and understanding the genetic underpinning of IA biosynthesis.
Keyword ：
basic helix-loop-helix basic helix-loop-helix indole alkaloid biosynthesis indole alkaloid biosynthesis lineage-specific genes lineage-specific genes medicinal plant medicinal plant Strobilanthes cusia Strobilanthes cusia whole-genome sequencing whole-genome sequencing
Cite：
Copy from the list or Export to your reference management。
| GB/T 7714 | Hu, Yongle , Ma, Dongna , Ning, Shuju et al. High-Quality Genome of the Medicinal Plant Strobilanthes cusia Provides Insights Into the Biosynthesis of Indole Alkaloids [J]. | FRONTIERS IN PLANT SCIENCE , 2021 , 12 . |
| MLA | Hu, Yongle et al. "High-Quality Genome of the Medicinal Plant Strobilanthes cusia Provides Insights Into the Biosynthesis of Indole Alkaloids" . | FRONTIERS IN PLANT SCIENCE 12 (2021) . |
| APA | Hu, Yongle , Ma, Dongna , Ning, Shuju , Ye, Qi , Zhao, Xuanxuan , Ding, Qiansu et al. High-Quality Genome of the Medicinal Plant Strobilanthes cusia Provides Insights Into the Biosynthesis of Indole Alkaloids . | FRONTIERS IN PLANT SCIENCE , 2021 , 12 . |
| Export to | NoteExpress RIS BibTex |
Version ：
Abstract ：
吲哚-3-甘油磷酸合酶(indole-3-glycerol phosphate synthase,IGPS)是广泛参与生物体内色氨酸、生长素等吲哚化合物合成途径中重要的关键酶之一。为了研究BcIGPS在马蓝吲哚类生物碱合成中的作用,基于马蓝转录组数据,通过RT-PCR技术从马蓝中克隆得到IGPS基因序列,命名为BcIGPS;利用生物信息学分析BcIGPS序列特性;运用qPCR分析BcIGPS在马蓝不同器官及外源诱导处理下的时空表达情况;构建pET-32a-BcIGPS原核表达载体,并优化诱导表达条件。结果表明:BcIGPS(GenBank登录号:MT210517)全长为1176 bp,包含1个开放阅读框(ORF),编码392个氨基酸,具丝氨酸(Ser)、苏氨酸(Thr)、酪氨酸(Tyr)磷酸化位点31个,无跨膜结构,无信号肽,亚细胞定位于叶绿体中。BcIGPS含有product(indole)活性结构域和IGPS、TrpC特异性位点。qPCR分析结果显示,BcIGPS基因在不同器官的相对表达丰度依次为:叶>茎>花>根;其响应茉莉酸甲酯(MeJA)、脱落酸(ABA)、水杨酸(SA)、乙烯利(ETH)外源诱导信号的诱导,经MeJA和ETH处理后,分别在24h和36h最高,为初始水平的5.53、6.87倍;在SA处理下,BcIGPS表达响应最为强烈,呈先骤升后骤降的变化趋势,在12 h最高达初始水平的33.13倍;ABA处理后,其表达量变化不显著。所构建的pET-32a-BcIGPS原核表达载体在大肠杆菌BL21中表达,其最适条件为37℃、0.4 mmol/L IPTG培养3 h,BcIGPS重组蛋白主要以包涵体形式存在,且蛋白分子量与预测相符。
Keyword ：
BcIGPS BcIGPS 原核表达 原核表达 基因克隆 基因克隆 表达分析 表达分析 马蓝 马蓝
Cite：
Copy from the list or Export to your reference management。
| GB/T 7714 | 蔡国倩 , 宁书菊 , 叶齐 et al. 马蓝IGPS基因的克隆、表达分析及原核表达 [J]. | 热带作物学报 , 2021 , 42 (08) : 2167-2174 . |
| MLA | 蔡国倩 et al. "马蓝IGPS基因的克隆、表达分析及原核表达" . | 热带作物学报 42 . 08 (2021) : 2167-2174 . |
| APA | 蔡国倩 , 宁书菊 , 叶齐 , 胡永乐 , 马小毛 , 魏道智 . 马蓝IGPS基因的克隆、表达分析及原核表达 . | 热带作物学报 , 2021 , 42 (08) , 2167-2174 . |
| Export to | NoteExpress RIS BibTex |
Version ：
Abstract ：
目的克隆马蓝邻氨基苯甲酸合成酶(anthranilate synthase,AS)BcASB基因(GenBank登录号QCF61930.1),并对其进行生物信息学分析、时空表达分析以及检测马蓝有效成分靛蓝、靛玉红积累量随时间的变化。方法通过RT-PCR和RACE技术,克隆BcASB基因全长,应用生物信息学的方法对该基因编码的蛋白进行各种理化性质测定,二级结构和三级结构预测分析以及对核苷酸和氨基酸序列进行比对;利用qRT-PCR技术检测BcASB基因在马蓝不同器官(根、茎、叶)中的表达模式以及在外源诱导子茉莉酸甲酯(methyl-jasmonate,MeJA)、脱落酸(abscisic acid,ABA)、水杨酸(salicylic acid,SA)和乙烯利(ethylene,ETH)诱导下的表达情况;同时运用HPLC测定吲哚类生物碱靛蓝、靛玉红含量的变化情况。结果克隆获得BcASB基因,开放阅读框(open reading frame,ORF)长度为765 bp,编码256个氨基酸,生物信息学表明,该蛋白不含信号肽且无跨膜区,亚细胞结构定位于叶绿体;qRT-PCR检测结果表明,BcASB基因在马蓝叶和茎中的表达量较高,在根中表达较低;BcASB基因可响应不同外源诱导处理,而影响其转录;HPLC检测结果显示靛蓝、靛玉红含量有着明显的变化。结论成功克隆马蓝邻氨基苯甲酸合成酶BcASB基因,为进一步阐释该基因在马蓝吲哚类生物碱合成途径的作用及表达调控研究奠定基础。
Keyword ：
克隆 克隆 水杨酸 水杨酸 生物信息学分析 生物信息学分析 脱落酸 脱落酸 茉莉酸甲酯 茉莉酸甲酯 表达分析 表达分析 邻氨基苯甲酸合成酶 邻氨基苯甲酸合成酶 马蓝 马蓝
Cite：
Copy from the list or Export to your reference management。
| GB/T 7714 | 马小毛 , 宁书菊 , 叶齐 et al. 马蓝BcASB基因的克隆、生物信息学及表达分析 [J]. | 中草药 , 2021 , 52 (18) : 5697-5706 . |
| MLA | 马小毛 et al. "马蓝BcASB基因的克隆、生物信息学及表达分析" . | 中草药 52 . 18 (2021) : 5697-5706 . |
| APA | 马小毛 , 宁书菊 , 叶齐 , 胡永乐 , 蔡国倩 , 魏道智 . 马蓝BcASB基因的克隆、生物信息学及表达分析 . | 中草药 , 2021 , 52 (18) , 5697-5706 . |
| Export to | NoteExpress RIS BibTex |
Version ：
Abstract ：
为了厘清土地利用变化与生态系统服务之间的互作关系,本研究采用生物量因子和社会经济因子调整系数修正传统生态系统服务价值评估模型,对1999—2019年安溪县所属24个乡镇生态系统服务价值(ESV)进行评估,探究其对土地利用变化的生态响应。结果表明:研究期间,安溪县24个乡镇ESV呈整建制递减,减幅为0.004～0.295亿元;林地和耕地对ESV的贡献率最大,其次为草地和水域,其余地类对ESV的贡献为负值;将其他地类转变为林地可提高ESV,而转变为园地面积(主要是茶园面积)则导致ESV降低。采用化肥单一化宿根栽培管理茶园导致ESV降低,而茶园生态栽培能有效提高茶园土壤微生物多样性,改善土壤肥力,提高ESV。
Keyword ：
土地利用 土地利用 土地退化 土地退化 生态系统服务价值 生态系统服务价值 茶园 茶园 通径分析 通径分析
Cite：
Copy from the list or Export to your reference management。
| GB/T 7714 | 江文甲 , 林满红 , 翁佩莹 et al. 福建安溪县乡镇土地生态系统服务价值的演变机制 [J]. | 应用生态学报 , 2021 , 32 (12) : 4457-4466 . |
| MLA | 江文甲 et al. "福建安溪县乡镇土地生态系统服务价值的演变机制" . | 应用生态学报 32 . 12 (2021) : 4457-4466 . |
| APA | 江文甲 , 林满红 , 翁佩莹 , 魏道智 , 林文雄 , 苏凯 . 福建安溪县乡镇土地生态系统服务价值的演变机制 . | 应用生态学报 , 2021 , 32 (12) , 4457-4466 . |
| Export to | NoteExpress RIS BibTex |
Version ：
Abstract ：
目的克隆马蓝Baphicacanthus cusia吲哚类生物碱合成途径的色氨酸合成酶(tryptophan synthase,TSB)基因,命名为BcTSB(GenBank登录号AYM45644.1),对其生物信息学和表达进行分析。方法基于前期马蓝转录组数据库,获得BcTSB基因开放阅读框(ORF),运用生物信息学手段对基因功能做出初步预测,构建pET32a-BcTSB原核表达载体,并转化大肠杆菌BL21(DE3),IPTG诱导表达后进行SDS-PAGE检测。通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测马蓝不同组织(根、茎、叶)中TSB表达水平。结果克隆的BcTSB基因ORF长度为1452bp,编码483个氨基酸,生物信息学预测为亲水性蛋白,定位于叶绿体,该蛋白相对分子质量为51 665.89,pET-32a载体包含18 000的标签。SDS-PAGE分析在70 000处出现目的蛋白条带,与理论预期值大小一致。qRT-PCR分析显示BcTSB基因在马蓝不同组织中均有表达,且在茎中的表达量最高。结论通过对BcTSB基因的克隆及表达分析,为进一步研究该基因功能及调控奠定了实验基础。
Keyword ：
BcTSB基因 BcTSB基因 qRT-PCR qRT-PCR 克隆 克隆 原核表达 原核表达 生物信息学分析 生物信息学分析 马蓝 马蓝
Cite：
Copy from the list or Export to your reference management。
| GB/T 7714 | 马小毛 , 宁书菊 , 叶齐 et al. 马蓝色氨酸合成酶基因的克隆及表达分析 [J]. | 中草药 , 2020 , 51 (24) : 6328-6336 . |
| MLA | 马小毛 et al. "马蓝色氨酸合成酶基因的克隆及表达分析" . | 中草药 51 . 24 (2020) : 6328-6336 . |
| APA | 马小毛 , 宁书菊 , 叶齐 , 胡永乐 , 蔡国倩 , 魏道智 . 马蓝色氨酸合成酶基因的克隆及表达分析 . | 中草药 , 2020 , 51 (24) , 6328-6336 . |
| Export to | NoteExpress RIS BibTex |
Version ：
Abstract ：
本研究利用Illumina HiSeq~(TM)2000对马蓝转录组进行高通量测序,使用软件MicroSAtellite (MISA)分析转录组中的SSR位点信息。通过组装马蓝转录组数据获得了51 381条Unigene,并对获得的Unigene进行SSR检测,共检测到8 471个SSR位点,其分布在6 782条Unigene中,出现的频率为16.49%。SSR中以二核苷酸和三核苷酸重复类型为主,其中二核苷酸以重复单元AT/TA为主,占18.14%,其余类型的重复单元相对较少。SSR所在序列功能注释结果显示在Nr和SwissProt中分别有5 932和4 285条序列被注释,同时SSR所在序列还被注释到47个GO分类,25个KOG分类和29个KEGG代谢通路中。通过设计、筛选,共获得5 819对引物组合,随机挑选的18对引物中有13对引物扩增出符合预期大小的条带。马蓝SSR出现的频率高,重复种类丰富,为研究马蓝遗传多样性、基因定位和品质改良等提供了科学依据。
Keyword ：
SSR SSR 转录组 转录组 马蓝(Baphicacanthus cusia) 马蓝(Baphicacanthus cusia)
Cite：
Copy from the list or Export to your reference management。
| GB/T 7714 | 公培民 , 宁书菊 , 叶齐 et al. 马蓝转录组中SSR位点信息特征分析 [J]. | 分子植物育种 , 2020 , 18 (12) : 4000-4008 . |
| MLA | 公培民 et al. "马蓝转录组中SSR位点信息特征分析" . | 分子植物育种 18 . 12 (2020) : 4000-4008 . |
| APA | 公培民 , 宁书菊 , 叶齐 , 于剑 , 赵璇璇 , 沈继伟 et al. 马蓝转录组中SSR位点信息特征分析 . | 分子植物育种 , 2020 , 18 (12) , 4000-4008 . |
| Export to | NoteExpress RIS BibTex |
Version ：
Export
| Results： |
Selected to |
| Format： |
