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Comprehensive Expression Analysis of the WRKY Gene Family in Phoebe bournei under Drought and Waterlogging Stresses SCIE
期刊论文 | 2024 , 25 (13) | INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES
WoS CC Cited Count: 4
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Abstract :

In response to biotic and abiotic stresses, the WRKY gene family plays a crucial role in plant growth and development. This study focused on Phoebe bournei and involved genome-wide identification of WRKY gene family members, clarification of their molecular evolutionary characteristics, and comprehensive mapping of their expression profiles under diverse abiotic stress conditions. A total of 60 WRKY gene family members were identified, and their phylogenetic classification revealed three distinct groups. A conserved motif analysis underscored the significant conservation of motif 1 and motif 2 among the majority of PbWRKY proteins, with proteins within the same class sharing analogous gene structures. Furthermore, an examination of cis-acting elements and protein interaction networks revealed several genes implicated in abiotic stress responses in P. bournei. Transcriptomic data were utilized to analyze the expression patterns of WRKY family members under drought and waterlogged conditions, with subsequent validation by quantitative real-time PCR (RT-qPCR) experiments. Notably, PbWRKY55 exhibited significant expression modulation under drought stress; PbWRKY36 responded prominently to waterlogging stress; and PbWRKY18, PbWRKY38, and PbWRKY57 demonstrated altered expression under both drought and waterlogging stresses. This study revealed the PbWRKY candidate genes that potentially play a pivotal role in enhancing abiotic stress resilience in P. bournei. The findings have provided valuable insights and knowledge that can guide further research aimed at understanding and addressing the impacts of abiotic stress within this species.

Keyword :

drought stress drought stress Lauraceae Lauraceae Phoebe bournei Phoebe bournei waterlogging stress waterlogging stress WRKY WRKY

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GB/T 7714 Wang, Zhongxuan , You, Limei , Gong, Na et al. Comprehensive Expression Analysis of the WRKY Gene Family in Phoebe bournei under Drought and Waterlogging Stresses [J]. | INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES , 2024 , 25 (13) .
MLA Wang, Zhongxuan et al. "Comprehensive Expression Analysis of the WRKY Gene Family in Phoebe bournei under Drought and Waterlogging Stresses" . | INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES 25 . 13 (2024) .
APA Wang, Zhongxuan , You, Limei , Gong, Na , Li, Can , Li, Zhuoqun , Shen, Jun et al. Comprehensive Expression Analysis of the WRKY Gene Family in Phoebe bournei under Drought and Waterlogging Stresses . | INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES , 2024 , 25 (13) .
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闽楠bZIP基因家族的鉴定与表达分析
期刊论文 | 2024 , 53 (02) , 221-228 | 福建农林大学学报(自然科学版)
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Abstract :

【目的】基于闽楠全基因组数据对bZIP(碱性亮氨酸拉链)基因家族进行鉴定,并研究其在闽楠根系水分胁迫下的作用,确定关键调控基因。为进一步探究闽楠根系抵御逆境胁迫的分子机制提供了参考。【方法】利用生物信息学方法进行系统进化、保守基序、基因结构、启动子顺式势作用元件以及蛋白互作分析,并通过qRT-PCR验证基因在水分胁迫下的表达模式。【结果】在闽楠基因组中共鉴定出52个bZIP转录因子,划分为10个亚家族;顺式作用元件分析表明,PbbZIP可能响应光照、生物与非生物胁迫以及生长发育等生物学过程;转录组数据分析显示,PbbZIP15在干旱/水涝胁迫下的表达量较高,PbbZIP40在干旱胁迫下的表达量较高;qRT-PCR验证结果与转录组数据基本一致。【结论】PbbZIP15和PbbZIP40是调控闽楠根系水分胁迫的2个关键基因。

Keyword :

bZIP基因家族 bZIP基因家族 全基因组鉴定 全基因组鉴定 水分胁迫 水分胁迫 表达分析 表达分析 闽楠 闽楠

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GB/T 7714 万露露 , 王中煊 , 沈军 et al. 闽楠bZIP基因家族的鉴定与表达分析 [J]. | 福建农林大学学报(自然科学版) , 2024 , 53 (02) : 221-228 .
MLA 万露露 et al. "闽楠bZIP基因家族的鉴定与表达分析" . | 福建农林大学学报(自然科学版) 53 . 02 (2024) : 221-228 .
APA 万露露 , 王中煊 , 沈军 , 曹泽宇 , 陈世品 , 苏小青 . 闽楠bZIP基因家族的鉴定与表达分析 . | 福建农林大学学报(自然科学版) , 2024 , 53 (02) , 221-228 .
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杜鹃叶绿体基因组特征及密码子偏好性分析
期刊论文 | 2023 , 51 (13) , 54-59 | 江苏农业科学
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Abstract :

为了确定杜鹃(Rhododendron simsii)叶绿体基因组密码子的使用模式,为杜鹃花科叶绿体基因组学研究提供参考依据,绘制了杜鹃叶绿体基因组图谱,对三大功能基因进行分类,统计各蛋白编码基因密码子的3位碱基的GC含量、有效密码子数、同义密码子相对使用度,开展中性绘图分析和PR2-plot等分析,并系统分析影响杜鹃密码子偏好性的各种因素,从而筛选出了最优密码子。结果显示,杜鹃叶绿体基因组全长206 912 bp,大单拷贝区为110 234 bp,小单拷贝区为2 606 bp,反向重复区为47 036 bp。蛋白编码序列GC含量为36%,密码子第3位偏好使用A/U,ENC值范围为37.48~57.13,说明其密码子使用偏好性较弱;中性绘图分析显示GC_(12)和GC_3的相关系数为0.255,拟合的回归系数为0.345;PR2-plot分析显示G>C,T>A;有30个密码子的RSCU值大于1,以U或A结尾的有29个,影响其密码子使用偏好性的最主要为自然选择压力;最终鉴定出最优密码子8个,分别为GCA、GAU、UUG、CCA、CGU、UCA、GUA、UAU。可见,杜鹃叶绿体基因组具典型的双链环状构造,密码子偏好性较弱,主要受到自然和突变的共同影响。

Keyword :

叶绿体基因组 叶绿体基因组 密码子偏好性 密码子偏好性 最优密码子 最优密码子 杜鹃 杜鹃

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GB/T 7714 万露露 , 范敦锦 , 王中煊 et al. 杜鹃叶绿体基因组特征及密码子偏好性分析 [J]. | 江苏农业科学 , 2023 , 51 (13) : 54-59 .
MLA 万露露 et al. "杜鹃叶绿体基因组特征及密码子偏好性分析" . | 江苏农业科学 51 . 13 (2023) : 54-59 .
APA 万露露 , 范敦锦 , 王中煊 , 龚娜 , 丁祥青 , 陈世品 et al. 杜鹃叶绿体基因组特征及密码子偏好性分析 . | 江苏农业科学 , 2023 , 51 (13) , 54-59 .
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福州市晋安区药用植物资源与空间格局分析
期刊论文 | 2023 , 46 (02) , 307-312 | 中药材
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Abstract :

目的:查清晋安区药用植物资源本底,为药用植物资源管理和利用提供依据。方法:采用样方法和样线法,记录物种及其蕴藏量数据,对晋安区药用植物物种类群、物种构成、生活型和药用部位进行分类统计,运用随机样方分析法和Morisita分布指数进行空间格局分析。结果:晋安区药用植物资源空间格局呈聚集分布,共1 067种,隶属于193科632属,其中苔藓植物4科4属4种,蕨类植物38科51属80种,裸子植物9科15属19种,被子植物142科562属964种。结论:晋安区药用植物资源丰富,生活型和药用部位类型多样,聚集分布的药用植物资源有利于开发和保护,有较大的社会、生态和经济价值。

Keyword :

晋安区 晋安区 空间格局 空间格局 药用植物资源 药用植物资源 资源调查 资源调查

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GB/T 7714 罗开金 , 赵鹏 , 雷银法 et al. 福州市晋安区药用植物资源与空间格局分析 [J]. | 中药材 , 2023 , 46 (02) : 307-312 .
MLA 罗开金 et al. "福州市晋安区药用植物资源与空间格局分析" . | 中药材 46 . 02 (2023) : 307-312 .
APA 罗开金 , 赵鹏 , 雷银法 , 陈世品 , 苏小青 . 福州市晋安区药用植物资源与空间格局分析 . | 中药材 , 2023 , 46 (02) , 307-312 .
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福州市闽江公园景观植物多样性研究
期刊论文 | 2022 , 41 (06) , 91-96 | 中国野生植物资源
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Abstract :

目的:摸清闽江公园景观植物家底,为公园景观建设提供科学依据。方法:采用踏查法和样线法,记录植物种名、数量等信息,统计科、属、种组成。采用定性定量法对景观植物的种源、配置、观赏特性及花果期分析。运用色卡比色法对观花植物的花冠或花萼颜色进行对比和统计。结果:调查到景观植物97科246属382种,其中双子叶植物72科169属264种,单子叶植物18科65属102种,裸子植物6科11属15种,蕨类植物1科1属1种。观赏特性上,观叶>观花>观形>观果。植物的花果期和花色与气温相关性强。结论:闽江公园树种组成丰富,观赏价值高,为今后公园管理和建设提供参考。

Keyword :

景观植物 景观植物 花果期 花果期 花色 花色 闽江公园 闽江公园

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GB/T 7714 罗开金 , 黄秋淋 , 柳明珠 et al. 福州市闽江公园景观植物多样性研究 [J]. | 中国野生植物资源 , 2022 , 41 (06) : 91-96 .
MLA 罗开金 et al. "福州市闽江公园景观植物多样性研究" . | 中国野生植物资源 41 . 06 (2022) : 91-96 .
APA 罗开金 , 黄秋淋 , 柳明珠 , 余玉云 , 董建文 , 陈世品 et al. 福州市闽江公园景观植物多样性研究 . | 中国野生植物资源 , 2022 , 41 (06) , 91-96 .
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扒晒对麻竹叶片及竹笋碳氮产物的影响
期刊论文 | 2022 , 51 (02) , 86-92 | 西部林业科学
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Abstract :

为探究扒晒对麻竹叶片生理及竹笋营养成分的影响,筛选最佳扒晒配比组合,采用L_9(3~4)正交试验设计,对麻竹进行不同日积温、晒目历时和晒目深度试验。结果显示:各处理对叶片叶绿素、淀粉、可溶性糖、非结构性碳水化合物(NSC)和可溶性蛋白均具有显著的影响;3个影响因素中晒目深度对叶片光合色素的影响程度最大,其次为晒目历时,日积温影响最低;晒目历时对叶片各生理指标的影响最大,其次为晒目深度,日积温影响最小。各扒晒处理对麻竹竹笋营养物质含量均有显著影响;晒目深度对麻竹笋营养物质影响最大,其次为日积温,晒目历时影响最小。综合考虑各处理对麻竹叶片生理与竹笋营养成分影响,得出最佳扒晒组合为日积温大于等于180℃/d、晒目历时10 d、晒目深度为30 cm。

Keyword :

叶片生理 叶片生理 扒晒 扒晒 竹笋 竹笋 营养物质 营养物质 麻竹 麻竹

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GB/T 7714 王敏 , 赵婷 , 郑风英 et al. 扒晒对麻竹叶片及竹笋碳氮产物的影响 [J]. | 西部林业科学 , 2022 , 51 (02) : 86-92 .
MLA 王敏 et al. "扒晒对麻竹叶片及竹笋碳氮产物的影响" . | 西部林业科学 51 . 02 (2022) : 86-92 .
APA 王敏 , 赵婷 , 郑风英 , 荣俊冬 , 陈礼光 , 郑郁善 et al. 扒晒对麻竹叶片及竹笋碳氮产物的影响 . | 西部林业科学 , 2022 , 51 (02) , 86-92 .
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锥栗β-淀粉酶基因家族的全基因组鉴定与分析 CSCD
期刊论文 | 2021 , 41 (05) , 545-553 | 森林与环境学报
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Abstract :

β-淀粉酶(BAM)家族是催化植物淀粉转化为麦芽糖的重要酶,在调控植物生长发育和非生物胁迫耐受过程中有重要作用。为了解锥栗ChBAM基因家族的结构和表达特征,对ChBAM进行了全基因组鉴定和进化分析,并研究了ChBAM在不同组织、果实发育和种子萌发期间的表达模式。结果表明,鉴定出9个ChBAM基因,均具有典型的Glyco_hydro_14结构域,分为4个组(Ⅰ~Ⅳ组),与其他物种比较,ChBAM家族成员和枳CtBAM在进化关系上更为接近。葡糖基水解酶结构域、基因结构和基序分析表明ChBAM家族基因高度保守。3个ChBAM蛋白与α-淀粉酶(AMY)、4-α-葡聚糖转移酶(DPE)和淀粉异构酶(ISA)等蛋白互作。ChB AM基因启动子顺式作用元件分析表明其参与了多种非生物胁迫。锥栗ChB AM家族基因具有明显的组织表达差异性,ChB AM1/9在花、叶柄、壳斗部位表达较高。在果实发育和种子萌发阶段,ChB AM1/6/9表达较高,表明ChB AM1/6/9可能在锥栗果实淀粉代谢过程发挥作用。

Keyword :

β-淀粉酶 β-淀粉酶 基因家族 基因家族 淀粉代谢 淀粉代谢 锥栗 锥栗

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GB/T 7714 江淑珍 , 连辉 , 熊远芳 et al. 锥栗β-淀粉酶基因家族的全基因组鉴定与分析 [J]. | 森林与环境学报 , 2021 , 41 (05) : 545-553 .
MLA 江淑珍 et al. "锥栗β-淀粉酶基因家族的全基因组鉴定与分析" . | 森林与环境学报 41 . 05 (2021) : 545-553 .
APA 江淑珍 , 连辉 , 熊远芳 , 罗开金 , 苏小青 , 陈世品 . 锥栗β-淀粉酶基因家族的全基因组鉴定与分析 . | 森林与环境学报 , 2021 , 41 (05) , 545-553 .
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闽楠大苗培育的密度效应分析
期刊论文 | 2019 , (04) , 96-97 | 江西农业
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Abstract :

在闽楠大苗培育过程中,对3个龄级的苗木设置不同的培育密度,调查苗高、地径、枝下高和冠径等指标以检测对闽楠苗木生长的影响。结果表明,较高密度有利于一年生苗的高生长,二年生和三年生苗高则随密度降低而增大,但低密度也造成苗高的整齐度下降;低密度对地径生长影响显著,最大效应可以达到1.42倍;一年生苗木的枝下高随培育密度下降而增大,二年生、三年生苗木的枝下高则随培育密度下降而减小;低密度培育对冠径的效应最大,可以达到最高密度的1.58倍。因此,大苗培育可采用较低密度,效益显著。

Keyword :

大苗培育 大苗培育 密度 密度 苗木生长 苗木生长 闽楠 闽楠

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GB/T 7714 林文俊 , 谢健 , 黄如楚 et al. 闽楠大苗培育的密度效应分析 [J]. | 江西农业 , 2019 , (04) : 96-97 .
MLA 林文俊 et al. "闽楠大苗培育的密度效应分析" . | 江西农业 04 (2019) : 96-97 .
APA 林文俊 , 谢健 , 黄如楚 , 陈世品 , 苏小青 . 闽楠大苗培育的密度效应分析 . | 江西农业 , 2019 , (04) , 96-97 .
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保水剂和氮肥混施对沿海沙地3个竹种抗性生理及叶绿素荧光特性的影响 CSCD PKU
期刊论文 | 2019 , 48 (03) , 378-385 | 福建农林大学学报(自然科学版)
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Abstract :

以勃氏甜龙竹(Dendrocalamus brandisii)、花吊丝竹(Dendrocalamus minor)和大头典竹(Dendrocalamopsis beecheyana)3个竹种为试验材料,研究不同用量保水剂与氮肥混施对竹子叶片抗性生理和叶绿素荧光特性的影响.结果表明:(1)保水剂和氮肥混施减缓了3个竹种叶片叶绿素含量的下降,增强了超氧化物歧化酶(SOD)和过氧化物酶(POD)活性,提高了可溶性糖和可溶性蛋白含量,减少了丙二醛(MDA)含量和电解质渗透率的上升;(2)在一定用量保水剂和氮肥处理下,3个竹种能够提高最大光化学效率(F_v/F_m)、PSⅡ实际光化学效率(Φ_(PSⅡ))、光化学猝灭系数(qP)和非光化学猝灭系数(qN),但不同处理间差异不显著;(3)不同用量保水剂和氮肥混施处理对3个竹种抗性生理与叶绿素荧光特性的影响存在差异,主成分分析法表明勃氏甜龙竹和花吊丝竹最佳处理为30 g·丛~(-1)保水剂和200 g·丛~(-1)氮肥混施,大头典竹最佳处理为60 g·丛~(-1)保水剂和400 g·丛~(-1)氮肥混施,勃氏甜龙竹和花吊丝竹在较低用量的保水剂和氮肥混施处理下就能够达到明显的效果.

Keyword :

保水剂 保水剂 叶绿素荧光 叶绿素荧光 抗性生理 抗性生理 氮肥 氮肥 沿海防护竹林 沿海防护竹林

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GB/T 7714 凡莉莉 , 薛磊 , 荣俊冬 et al. 保水剂和氮肥混施对沿海沙地3个竹种抗性生理及叶绿素荧光特性的影响 [J]. | 福建农林大学学报(自然科学版) , 2019 , 48 (03) : 378-385 .
MLA 凡莉莉 et al. "保水剂和氮肥混施对沿海沙地3个竹种抗性生理及叶绿素荧光特性的影响" . | 福建农林大学学报(自然科学版) 48 . 03 (2019) : 378-385 .
APA 凡莉莉 , 薛磊 , 荣俊冬 , 郑晶晶 , 郑郁善 , 苏小青 . 保水剂和氮肥混施对沿海沙地3个竹种抗性生理及叶绿素荧光特性的影响 . | 福建农林大学学报(自然科学版) , 2019 , 48 (03) , 378-385 .
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闽楠大苗新培育技术苗木生长性状分析
期刊论文 | 2019 , (02) , 52-53 | 现代农业研究
Abstract&Keyword Cite

Abstract :

采用新技术培育闽楠大苗,常规育苗培育的苗木做对照。研究结果发现,新技术培育的闽楠苗木的整齐度、平均苗高、平均地径等指标的表现都优于常规育苗技术。

Keyword :

地径 地径 大苗培育 大苗培育 苗高 苗高 闽楠 闽楠

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GB/T 7714 林文俊 , 谢健 , 陈世品 et al. 闽楠大苗新培育技术苗木生长性状分析 [J]. | 现代农业研究 , 2019 , (02) : 52-53 .
MLA 林文俊 et al. "闽楠大苗新培育技术苗木生长性状分析" . | 现代农业研究 02 (2019) : 52-53 .
APA 林文俊 , 谢健 , 陈世品 , 苏小青 . 闽楠大苗新培育技术苗木生长性状分析 . | 现代农业研究 , 2019 , (02) , 52-53 .
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